estimate-immune-score-analysis
该技能用于从批量表达矩阵计算 ESTIMATE 免疫与基质微环境评分，生成评分热图，并可在提供样本分组文件时进行分组比较与显著性统计。基于 R 脚本 CLI 执行，输出结构化结果表与图表，不支持单细胞分析或免疫细胞解卷积。
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更新于 11-05 00:16
数据与分析
17,418 个结果
experimental-data-analysis
实验数据统计分析技能，面向医学与科研场景，按可复现流程完成数据清洗、显著性检验与结果报告。支持t检验、方差分析及事后多重比较，并输出带时间戳的运行目录、图表与假设检验说明。
facs-gating-viz-style
用于美化流式细胞术圈门（FACS gating）图的技能，可生成适合论文发表的等高线、密度或散点风格图表，帮助完成可复现的数据分析输出。
faers-multi-drug-soc-planner
根据用户提供的药物集合、对照与目标SOC，生成完整的FAERS多药单系统器官分类安全性比较研究设计。每次输出Lite、Standard、Advanced、Publication+四种工作量配置，并推荐一个主方案，适合药物警戒比较研究规划。
fastqc-report-interpreter
用于解读测序数据 FASTQC 质量报告的技能，帮助分析 NGS 数据集的质量指标、识别质量问题和排查测序问题，并为 RNA-seq、DNA-seq、ChIP-seq 提供可操作建议。
fda-database
该技能通过 Python 统一接口查询 openFDA 公开 API，按需获取药品、器械、食品、兽医不良事件、召回、510(k)/PMA、UDI 及 UNII 物质等监管数据集，支持字段检索、聚合统计、分页与批量拉取，适用于药物警戒、器械合规研究等场景。
forest-plot-styler
forest-plot-styler 是一个用于美化 Meta 分析或亚组分析森林图的技能：读取 CSV/Excel 数据，定制比值比（OR）点大小、颜色、形状与置信区间线样式，自动计算并显示合并效应值，可输出 PNG、PDF 或 SVG。
gene-database
通过 NCBI E-utilities 与 NCBI Datasets API 查询 NCBI Gene 数据库的技能，可按基因符号或 ID 检索基因注释（RefSeq、GO 等），支持批量注释与速率限制处理。
gene-info
gene-info 是一个基因信息检索技能，可从 NCBI PubMed、NCBI Gene 和 Ensembl 获取指定基因的详细信息，包括文献发表数量、基因摘要与转录本数据，支持单基因查询、批量处理和文件输入，并可导出为 JSON 或 CSV。
gene-protein-expression-matrix-normalization
用于在绘图、聚类或探索性比较前，对基因或蛋白质表达矩阵做数值归一化的技能，支持 log2 变换、z-score 标准化和 min-max 缩放。不适用于 CPM/TPM/TMM/DESeq2 等计数模型归一化、批次校正或单细胞预处理。
gene-structure-mapper
gene-structure-mapper 是一个用于基因结构可视化的技能，可展示外显子与内含子，并支持结构域注释与突变位点标记。通过命令行脚本生成 SVG、PNG 或 PDF 图形，适用于需要结构化、可复现输出的数据分析流程。
geo-search-api
用于检索 NCBI GEO 数据库中基因表达 DataSets 与 Profiles 的技能，可按关键词、物种、作者等字段查找微阵列、RNA-seq 等基因组数据。需 Python 3.10+，通过 scripts/search_geo.py 调用 NCBI Entrez API 执行搜索。
gokegg-analysis
用于对 bulk RNA-seq 或 microarray 研究得到的基因列表执行 GO 与 KEGG 富集分析，并生成 GO/KEGG 合并气泡图的技能，仅支持 SYMBOL、ENSEMBL、ENTREZID 基因 ID 与人类、小鼠、大鼠物种数据库。
graph-interpretation
用于解读科研图表与数据可视化的技能：帮助解释研究展示中的图形、撰写论文图注、分析临床研究数据趋势，并针对不同受众生成说明与批判性评估。
gsea
在按统计量排序的基因列表上运行GSEA，生成富集结果表、运行评分表与富集曲线图，并支持仅用已有结果文件绘图。
gsva-analysis-and-visualization
用于批量表达矩阵的通路级 GSVA/ssGSEA 差异分析技能：读取表达矩阵与样本分组文件，计算通路富集分数，配合 limma 做病例对照比较，并可从已保存结果生成热图 PDF。
hipaa-compliance-auditor
面向医疗文本的临床级 PII/PHI 检测与去标识化工具，扫描全部 18 类 HIPAA 标识符并给出置信度评分，可生成审计日志。仅为辅助工具，不能替代人工 HIPAA 合规审查，也不适用于 DICOM 影像或结构化数据库匿名化。
hmdb-database
该技能用于访问人类代谢组数据库（HMDB），支持按名称、结构或 HMDB 编号检索代谢物，并提取化学、生物学与临床字段，适合代谢组学数据准备与跨库映射。
immune-pathway-analysis
该技能用于从批量表达矩阵、分组文件和本地免疫 Reactome 基因集表运行 GSVA 或 ssGSEA 免疫通路评分，并用 limma 比较两组样本间的通路差异，输出差异表、评分矩阵、热图及可复现记录。
kegg-database
通过 KEGG REST API 直接查询通路、基因、化合物、酶、疾病与药物记录的技能，适合需要 HTTP 级精确控制或按 KEGG ID 定向检索的学术用途。
lab-budget-forecaster
实验室预算预测技能，用于计算科研经费可用月数（runway），支持一次性支出、币种与输出文件设置，并给出关键日期预警、削减成本情景和过渡资金提醒。
lightgbm-analysis
LightGBM Analysis 是一个用 R 编写的命令行技能，用于在表格数据上训练 LightGBM 模型，输出模型指标、特征重要性排序表与重要性图，结果按 table/、figure/、data/ 目录标准化存放。
lncrna-regulatory-network-construction-analysis
用于基于本地ceRNA参考表构建lncRNA-mRNA调控网络的生信分析技能：从目标基因和/或lncRNA列表出发，通过共享miRNA投射得到网络表、三方证据表和PDF网络图，支持analyze、visualize、full三种模式。
medical-vector-search
面向医学研究主题的向量数据库检索与循证问答技能：先把用户问题改写为专业检索式，再调用内置脚本查询知识库，基于高相关文档生成带引用的答案，避免仅依赖模型内部知识。