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facs-gating-viz-style

数据与分析

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更新于 10-15 16:44

技能介绍

用途:该技能用于流式细胞术圈门图的可视化美化,目标是产出适合论文发表(publication-ready)的图表,并适用于需要结构化执行、明确假设与清晰输出边界的数据分析流程。

主要能力:支持等高线图(contour)、密度可视化(density)和散点图(dot)三种绘图风格;提供结构化执行路径,使输出保持一致、便于复核;要求在执行前明确输入、输出、范围与假设。

使用方式:需 Python 3.10+。核心脚本为 scripts/main.py,主要参数包括 --data/-d(必填,FCS 文件路径)与 --style/-s(可选,默认 contour,可选 contour、density、dot)。示例:python scripts/main.py --data fcs_file.fcs --style contour。可先用 python -m py_compile scripts/main.py 校验脚本,再用 python scripts/main.py --help 查看帮助。若脚本使用固定设置,需编辑文件内 CONFIG 块或文档化参数后运行。

适用场景:需要为流式细胞术圈门结果生成可复现、可审阅的发表级图表的分析任务;输入缺失或有执行错误时提供回退路径的场景。

限制:依赖项未明确固定版本;无外部 API 调用;脚本在本地执行,涉及文件系统读写。参数、阈值与领域约束需先澄清,超出文档范围时应停止而非猜测。生命周期状态为 Draft,已知问题为无。实际输出效果、性能与收费信息暂未提供。