用途：分析下一代测序（NGS）的 FASTQC 质量控制报告，评估数据质量并给出改进建议，适用于 RNA-seq、DNA-seq、ChIP-seq 场景，也用于排查测序问题。
主要能力：解析质量指标（如每碱基序列质量、每序列质量分数、每碱基N含量、序列重复率、接头含量），按 PASS/WARNING/FAIL 判定；诊断常见问题并给出建议，例如读长末端质量低建议修剪最后 10-20 个碱基、接头污染建议用更严格参数重跑 cutadapt/Trimmomatic、重复率高建议去重或优化建库；支持批量分析并输出汇总，结合应用类型给出阈值建议（如 RNA-seq 可接受高达 40% 的重复率，DNA-seq 要求更严格，ChIP-seq 关注富集指标）。
使用方式：需 Python 3.10+。示例命令包括 python -m py_compile scripts/main.py、python scripts/main.py --help，以及 python scripts/fastqc_interpreter.py --input sample_fastqc.html、--batch "*fastqc.html" --output report.pdf、--input fastqc.html --application rna_seq。也可在代码中导入 from scripts.fastqc_interpreter import FASTQCInterpreter 并调用 analyze、parse_metrics、diagnose_issues、analyze_batch、get_recommendations 等方法。
限制：第三方依赖未固定版本；输入缺失或超出范围时应停止而非猜测；脚本失败需报告失败点并提供手动回退；不得编造文件、引用或执行结果。