biogrid-orcs
BioGRID ORCS 技能用于查询 BioGRID ORCS（CRISPR 筛选开放库）REST API，可获取物种、词表、筛选实验与基因评分数据。需提供 32 位 BioGRID Access Key，通过 Python 脚本 scripts/biogrid_client.py 执行。
Skill 广场
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更新于 11-05 00:16
数据与分析
17,418 个结果
brenda-database
通过 SOAP API 以编程方式访问 BRENDA 酶数据库的技能，用于获取动力学常数（Km、kcat、Vmax）、反应方程式、酶性质（最适 pH/温度、稳定性、抑制剂/激活剂）以及按底物、产物或 EC 号检索酶。
cerna-analysis
该技能用于从关键基因列表构建 ceRNA 调控网络，结合内置的 miRNA-mRNA 与 miRNA-lncRNA 参考表，导出 CSV 和 PDF。支持 combined、starbase、mirdb、mirtarbase 等数据集模式及 lncRNA 严格度设置。不适用于差异表达、单细胞、富集或生存分析。
chembl-database
用于查询 ChEMBL 数据库中生物活性分子、靶点、生物活性数据与已批准药物的技能，可按理化性质筛选候选化合物、检索 IC50/Ki/EC50 等活性数据及作用机制，依赖 Python 3.9+ 与 chembl_webresource_client。
circos-plot-generator
用于生成 Circos 环形基因组可视化配置文件的技能，支持 SNPs、CNVs、结构变异、细胞间通讯网络与自定义轨道，帮助无 Perl 经验的研究者产出可发表级环形图。
clinic-sample-size
用于临床研究样本量计算的工具，覆盖诊断、疗效、病因、预后四类研究。可按需传入统计参数，缺失时自动推断合理默认值，输出中文 Markdown 报告，默认保存到 output/ 目录。
clinicaltrials-database
通过 ClinicalTrials.gov API v2 查询全球临床试验注册信息的技能，支持按疾病、药物、地点、状态、申办方等条件检索试验，按 NCT ID 获取详情，并可导出数据用于分析。
clinpgx-database
ClinPGx 药物基因组学数据库访问技能，通过 REST API 查询基因-药物相互作用、CPIC 指南、等位基因功能与药品标签中的 PGx 内容，用于精准医疗和基因型指导用药。
clinvar-database
用于查询 NCBI ClinVar 数据库的工具集，可按基因、疾病表型或临床意义检索变异记录，获取临床意义与表型关系，并支持 VCF 注释与批量下载，适用于变异解读、报告分诊和注释流程。
cnv-caller-plotter
从全基因组测序数据检测拷贝数变异（CNV），支持CNV调用、基因组分段与出版级全基因组可视化，可导出BED格式，用于肿瘤基因组学、罕见病与群体遗传研究。
cosmic-database
用于通过脚本访问 COSMIC 数据库的技能：可下载突变数据集、查询癌症基因普查（CGC）并获取突变特征，适合需要规范化体细胞突变资源的基因组分析流程，凭 COSMIC 账号认证后运行。
crispr-screen-analyzer
用于处理混合CRISPR筛选数据，识别必需基因与候选命中。支持质控、对数倍数变化计算、RRA统计分析、命中筛选、基因水平聚合与多条件比较，适用于功能基因组学研究。
ctd-api
该技能通过批量查询 API 访问比较毒理基因组学数据库（CTD），检索化学品、基因、疾病、通路与表型之间的关联数据，适合需要查询 CTD、获取毒理基因组学数据或研究化学-疾病关系的场景。
data-stats-analysis
基于 scipy 与 statsmodels 的本地统计分析技能，支持 t 检验、方差分析、相关分析、假设检验与多重检验校正，兼容任意 LLM 提供商。
data-transform
基于 pandas、numpy、scikit-learn 的本地数据变换技能，用于清洗、规范化、重塑、过滤、合并与特征工程，兼容所有 LLM 提供方。
decision-curve-analysis
用于二分类预测模型临床效用评估的决策曲线分析技能：从单个临床 CSV 文件拟合 logistic 决策曲线模型，计算各阈值概率下的净获益，输出决策曲线与临床影响曲线图、文本摘要及可审计的 DCA 模型对象。
diffdock-molecular-docking
基于扩散模型的分子对接工具，可在未知结合位点时进行盲对接，预测配体与蛋白的3D结合构象并给出置信度评分，输出排序后的SDF构象文件与评分报告。
differential-expression-analysis
用于 bulk RNA-seq 或芯片表达数据的差异表达分析技能，比较病例组与对照组的差异基因。支持 limma、DESeq2、edgeR、t 检验和 Wilcoxon 方法，输出差异分析表、火山图和热图。
discharge-summary-writer
根据入院数据、住院经过、诊断、操作与随访计划生成住院出院小结，输出需医生复核。提供 Python 脚本，支持 standard、structured、json 三种格式及中英文输出；不接入实时 EMR，不校验药物相互作用，不自动生成 ICD-10 编码。
drugbank-database
用于以编程方式访问 DrugBank 药物与靶点数据的中文技能：下载、解析并分析 DrugBank XML，提取药物属性、相互作用、通路等信息，适合药物研究与知识图谱构建。
elastic-net-feature-selection
该技能用于对批量表达矩阵进行二分类（如病例与对照）的弹性网络逻辑回归特征选择。输入表达矩阵、分组文件和可选特征列表，通过cv.glmnet选择lambda，输出选定特征、系数表、系数路径图与交叉验证曲线。仅限二分类，不支持生存分析、多分类、单细胞或非表达数据。
ena-database
用于通过 ENA REST API 与 FTP/Aspera 访问欧洲核苷酸档案库，按登录号或元数据检索并下载序列、原始读段（FASTQ）、组装及相关元数据的技能。
encori-api
encori-api 是一个通过 Python 脚本查询 ENCORI（RNA 相互作用组百科全书，即 StarBase）数据库的技能，可获取 miRNA-靶标、RNA-RNA、RBP-靶标等调控相互作用数据。当用户需要检索 ENCORI 调控数据时可调用此技能。
ensembl-database
通过 Ensembl REST API 查询脊椎动物基因组数据的技能包，支持基因/ID 查找、序列获取、变异效应预测（VEP）以及同源关系和组装坐标映射等可复现工作流。