用途：当拥有蛋白结构（PDB）与配体（SMILES）但不知道结合位点时，可用该工具进行盲对接；也可用于生成多个候选3D结合构象并排序、虚拟筛选候选配体，以及为下游分析生成自动化对接输出（SDF构象＋评分）。
主要能力：使用扩散生成式采样生成多样化的配体结合构象；由独立的置信度模型为每个采样构象打分并按分数排序，保存为rank*.sdf；提供单对蛋白–配体的简单CLI推理；批量与进阶工作流记录在references/workflows_examples.md中。输出包括排序后的SDF构象文件（如rank1.sdf、rank2.sdf）和置信度评分报告confidence_scores.txt。
使用方式：先检查环境：python scripts/setup_check.py；再执行单次对接：python scripts/inference_runner.py --protein ./data/protein.pdb --ligand "CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O" --out_dir ./results。参数包括--protein（蛋白PDB路径）、--ligand（配体SMILES字符串）、--out_dir（输出目录，默认results/）。完整参数与默认值见references/parameters_reference.md；置信度解读、已知限制与预期精度范围见references/confidence_and_limitations.md。
依赖：Python、PyTorch、PyTorch Geometric / PyG、RDKit、ESM（以上版本均未指定）。
适用场景：药物发现流程中的自动对接、虚拟筛选、批量或替代输入（如基于序列的工作流，见references/workflows_examples.md）。
限制：各项依赖版本未提供；准确度、适用范围的说明需查阅上述参考文件；其余未在资料中说明的信息暂未提供。