bio-metabolomics-statistical-analysis
面向代谢组学数据的统计分析技能，覆盖单变量检验、倍数变化、PCA、PLS-DA、sPLS-DA、OPLS-DA、随机森林、ROC 与热图等生物标志物发现流程。
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更新于 11-05 00:16
数据与分析
17,411 个结果
bio-metabolomics-xcms-preprocessing
基于 XCMS3 的 LC-MS/MS 代谢组学预处理流程，覆盖峰检测、保留时间对齐、峰对应分组与间隙填充，适用于原始 mzML/mzXML 数据的特征表提取与质控。
bio-metagenomics-amr-detection
面向鸟枪法宏基因组的抗微生物抗性基因（resistome）分析技能：用RGI bwt等基于读段定量，结合AMRFinderPlus等基于contig/MAG判定存在，强调ARG命中不等于耐药表型。
bio-multi-omics-data-harmonization
用于多组学联合整合前的数据协调：在已归一化的各omic矩阵基础上，构建MultiAssayExperiment容器、选择逐omic变换、进行按视图缩放、确定统一批次策略并做缺失值分类处理。
bio-phylo-tree-visualization
该技能介绍如何用 Bio.Phylo 与 matplotlib 绘制、标注并导出系统发育树，并说明在需要环形布局、元数据热图或 BEAST HPD 区间时如何改用 ggtree、ETE4 或 iTOL，强调树图是含解释选择的论证而非中性图像。
bio-population-genetics-linkage-disequilibrium
基于 PLINK、scikit-allel、vcftools 的连锁不平衡（LD）分析技能，可计算 r² 与 D' 统计量、进行 LD 剪枝、识别单倍型块并可视化 LD 矩阵，常用于群体结构分析、GWAS 结果 clumping 与 LD 衰减分析。
bio-population-genetics-scikit-allel-analysis
基于 scikit-allel 的 Python 群体遗传学分析技能，用于读取 VCF、统计等位基因频率、计算多样性指标、执行 PCA 与选择扫描。
bio-population-genetics-selection-statistics
该技能用于群体遗传学中选择信号的检测与统计，基于 scikit-allel 或 vcftools 计算 Fst、Tajima's D、iHS、XP-EHH、NSL、Garud's H 等指标，并可组合成选择扫描图。
bio-proteomics-data-import
该技能负责将质谱数据导入 Python/R 并清理搜索引物记账行：剔除诱饵（REV__/Reverse）、污染物与仅位点鉴定行，选择正确定量列，并将 0 转为 NaN 后诊断缺失模式，为后续定量与分析打基础。
bio-proteomics-differential-abundance
基于 R/Python 的蛋白质差异丰度统计测试技能：用 limma/DEqMS 经验贝叶斯方差调节、proDA/msqrob2/MSstats 缺失值建模，在归一化对数强度矩阵上做调节检验，避免插补引发的系统性假阳性。
bio-proteomics-protein-inference
该技能用于蛋白质组学中的蛋白质推断：将肽段鉴定结果归并为蛋白质组，区分不可区分蛋白与可包含蛋白，指定代表蛋白，并控制蛋白质/蛋白组层面的FDR。
bio-read-qc-umi-processing
基于 umi_tools 的 UMI 提取、处理与去重技能，适用于文库制备含 UMI 的测序数据，可按 UMI 与比对位置去除 PCR 重复并准确计数分子。
bio-rna-quantification-tximport-workflow
将 Salmon、kallisto、RSEM 的转录本水平定量结果导入 R，用 tximport 或 tximeta 汇总为基因水平计数并生成长度偏移，供 DESeq2/edgeR 做差异表达分析。
bio-spatial-transcriptomics-spatial-proteomics
面向 CODEX/PhenoCycler、MIBI-TOF、IMC、CyCIF、Opal/Vectra mIF 等抗体多重成像数据的空间蛋白质组分析技能，将细胞×标志物强度矩阵转为表型与空间邻域，强调强度为连续且受混杂影响的信号。
bio-vcf-statistics
使用 bcftools stats 与 gtcheck 生成 VCF 变异统计、样本一致性与质量指标，适用于评估变异质量、比较样本和检查样本身份。
build-inspector
分析构建系统拓扑，识别独立构建单元、多产物风险与版本漂移隐患。通过定位构建配置、判断是否统一管理、追踪最终产物，输出构建根、拓扑类型、产物清单与风险标签。
report-template
report-template 是 antigravity-workflow-system 中 Scout 阶段的综合报告技能，用于汇总 build-inspector、runtime-inspector、git-forensics、concept-modeler 的分析结果，生成决策就绪的系统风险报告，供后续 blueprint 阶段使用。
accessibility-wcag-patterns
面向 CIA 政治数据平台的 WCAG 2.1 AA 无障碍实现技能，涵盖 ARIA 属性、键盘导航、屏幕阅读器优化与自动化无障碍测试，适用于设计新 UI 组件、表单、数据可视化及无障碍审计。
cia-data-integration
用于将瑞典政治数据接入 CIA 平台数据模型的技能，涵盖实体映射、数据转换，以及 Riksdagen、选举与财政数据源的一致性规则，并对数据新鲜度和安全合规提出要求。
matlab-plot-skill
用于整理和优化 MATLAB 图表的技能，解决子图拥挤、标题不清、图例遮挡、排版不适配页面以及 LaTeX/Overleaf 矢量 PDF 输出异常等问题，将粗糙图变成出版级图表。
hithink-finance-data
hithink-finance-data 是面向 Agent 的本地金融数据管理技能，通过 hithink-finance CLI 操作 DuckDB，支持初始化、同步、状态、校验、迁移、修复、清理、删除、只读 SQL 与导出，并提供 capabilities、schema 等自省命令。
hithink-finance-financials
hithink-finance CLI 的 A 股财务数据技能，用于查询利润表、资产负债表、现金流量表和单个报告期的财务指标，支持按报告期与时间窗口检索；价格行情需改用 hithink-finance-market，指数财务不在范围内。
hithink-finance-index
用于 Agent 通过 hithink-finance CLI 查询同花顺指数、概念、行业、地域及特色指数目录、指数成分股、指数快照与指数历史的工具。仅处理指数对象及其成分关系；个股行情与股票代码搜索需转用其他域。
hithink-finance-options
hithink-finance CLI 的期权查询技能，用于查询期权品种、合约详情、分时行情和日 K 数据，需按完整 thscode 与固定行情参数调用。