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该技能用于从人类蛋白质图谱(HPA)获取半定量蛋白质表达与空间定位数据,基于正常人体组织和癌症类型的免疫组化(IHC)结果,可映射基因符号到Ensembl ID、查询组织蛋白水平、亚细胞定位及按条件搜索基因。
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更新于 11-05 00:16
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该技能用于从人类蛋白质图谱(HPA)获取半定量蛋白质表达与空间定位数据,基于正常人体组织和癌症类型的免疫组化(IHC)结果,可映射基因符号到Ensembl ID、查询组织蛋白水平、亚细胞定位及按条件搜索基因。
InterPro 数据库访问技能:通过封装脚本查询 InterPro API,识别蛋白质的域、家族与位点,检索某家族或域的全部蛋白质、物种分布,并用蛋白质家族信息与 GO 术语注释基因组。
用于查询 JASPAR 数据库中转录因子(TF)结合谱的科研技能,支持获取位置频率矩阵(PFM)、位置权重矩阵(PWM)、元数据与序列推断等,需遵循官方 API 使用条款。
基于 NCBI E-utilities 的序列检索技能,通过封装脚本获取蛋白与核酸序列,支持登录号直查、CDS 翻译、基因加物种搜索、位点标签、PubMed 关联、专利序列及按物种与长度检索,输出结构化 JSON。
openFDA 数据库查询技能,通过封装脚本检索、统计和下载 openFDA API 中药品、器械、食品、烟草、化妆品、兽药、物质等 28 个端点的数据,支持精确匹配、分页下载与字段计数。
Open Targets Database 技能:通过封装脚本查询 Open Targets Platform GraphQL API,获取靶点-疾病关联、遗传学与组学证据、可成药性/安全性数据、已知药物及 GWAS/QTL 可信集等,用于药物靶点发现与优先级排序。
用于检索和下载实验测定的生物分子三维结构(蛋白质、核酸、结合配体)的 RCSB PDB 技能,支持属性搜索、序列/结构相似性搜索、全文搜索、元数据查询与坐标文件下载。
该技能通过 EBI Clustal Omega API 对 FASTA 格式的多个蛋白质序列进行多序列比对,并将结果保存到本地,用于评估相似性、识别保守结构域或分析关键残基。
该技能用于对用户提供的蛋白质氨基酸序列或 FASTA 文件进行同源序列搜索,默认使用 MMseqs2(ColabFold API,快速),失败或用户指定时改用 EBI BLAST,输出 Markdown 结果表并解读比对指标与功能。
通过 Python 包装脚本查询 PubChem 数据库的化学信息学技能,支持按名称、CID、SMILES、InChI 检索化合物,获取理化性质、同义词、安全危害、药理信息、结构相似性与子结构搜索、生物测定及交叉引用等。
通过命令行脚本访问 NCBI PubMed 与 PubMed Central API,用于检索科学文献、获取摘要与开放获取全文,并链接到其他 NCBI 生物数据库。
PyMOL 技能用于在无 GPU、无显示器的环境下通过 uv 与 OSMesa 软件渲染可视化、分析和渲染蛋白质与分子结构,可生成 PNG 图像和 .pse 会话文件。
QuickGO 数据库技能:通过 Python CLI 包装脚本查询 QuickGO 与 ECO 的 REST API,把基因映射到生物学过程、分子功能和细胞组分,并支持 GO 术语层级与 GO Slim 汇总。
该技能通过内置 Python CLI 查询 STRING 数据库,用于蛋白质互作、功能富集与同源分析。需先安装 uv,并按要求提示用户查看 STRING 使用条款。查询必须提供 NCBI Taxon ID,不能默认人类物种。
UniBind 数据库技能:查询经实验验证的转录因子(TF)结合位点,整合 9 个物种的 ChIP-seq 峰与 JASPAR 结合谱,用于获取直接 TF-DNA 相互作用数据集。
通过包装脚本程序化访问 UniProtKB、UniParc 与 UniRef,用于蛋白质检索、功能序列查询、ID 映射、历史数据查询和大规模元数据流式获取。需先安装 uv,并遵守 UniProt 许可与 API 条款。
docs-changelog 是 gemini-cli 的技能,用于根据版本号与原始更新日志数据,生成并格式化新版本的 changelog 文件(latest.md、preview.md、index.md)。
面向 AlloyDB for PostgreSQL 的基础技能,覆盖集群、实例与备份管理,并集成 AlloyDB MCP 工具,帮助完成数据库相关任务。
Google 官方技能,介绍 BigQuery 内建的机器学习与生成式 AI 能力,让用户直接在 SQL 查询中使用 AI.*、ML.* 等函数完成预测、异常检测、分类、语义搜索等分析任务。
Google 官方技能,用于在 BigQuery 中管理数据集、表和作业,支持运行 SQL 查询与资源管理。
用于生成 BigQuery DataFrames(BigFrames)Python 代码的技能,默认适用于涉及 BigQuery 的 Python 数据处理、分析与机器学习任务。
BigQuery 可观测性技能,提供 Google Cloud 环境配置、工具选型建议(INFORMATION_SCHEMA、REST API、Cloud Monitoring)以及跨遥测视图的高效 SQL 查询写法,用于查询与分析 BigQuery 作业、容量和存储等可观测性数据。
面向 Google Bigtable 的技能,帮助完成实例与表配置、行键模式设计及数据查询,涵盖控制面与数据面操作、性能诊断与安全确认等核心工作流。
Google Cloud 数据库选型引导技能,通过需求发现、推荐矩阵与基础设施代码草拟,帮助用户选择合适的 Google Cloud 数据库并生成待审阅的配置代码。