用途：检索与下载实验测定的生物分子三维结构，覆盖蛋白质、核酸及结合配体，数据来自 RCSB PDB。
主要能力：支持基于属性的搜索（先获取 schema 发现可搜索属性，再组合 JSON 查询）、序列相似性、结构相似性、序列基序、化学描述符匹配、全文搜索，以及元数据 GraphQL 查询和坐标文件下载。
使用方式：需先安装 uv 并确保其在 PATH 中。若工作区根目录不存在 .licenses/pdb_database_LICENSE.txt，需提示用户查看 https://www.rcsb.org/pages/usage-policy 的使用条款，并创建记录通知文本与时间戳的文件。优先使用提供的脚本，脚本会自动执行所需速率限制；仅在最后手段才用 curl、urllib 或原始 HTTP 请求访问 PDB API。输出始终重定向到文件，用 jq、grep 或简短 Python 片段解析，避免将大响应打印到 stdout。常用脚本包括 fetch_schema.py、search_pdb.py、download_coordinate_files.py、fetch_pdb_metadata.py。属性搜索流程为：获取 schema、grep 查找属性、组合并运行 JSON 查询；相似性搜索无需获取 schema。
适用场景：需要按物种、期刊、化学组分、连接类型等条件筛选条目；按序列或结构查找相似条目；按基序或化学描述符匹配；仅需少量元数据时用 GraphQL 查询比下载完整坐标更高效；需要原子坐标或 pdb/mmcif 文件时下载坐标。
限制：使用该技能需在输出中提及；完成任务后需用清晰语言解释查询做了什么，便于用户纠正错误假设；全文搜索应作为最后手段，优先使用更精确的属性搜索；需遵守 RCSB 使用政策。具体收费、价格、平台支持等信息暂未提供。