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COSMIC Database 是一个用于访问 COSMIC(Catalogue of Somatic Mutations in Cancer,癌症体细胞突变目录)癌症突变数据库的技能。COSMIC 是探索人类癌症体细胞突变的最大、最全面的数据库,收录了数千种癌症类型中的数百万个突变、经过专家整理的癌症基因列表、突变特征以及临床注释。该技能支持以编程方式下载和查询癌症突变数据,包括体细胞突变、Cancer Gene Census、突变特征、基因融合、结构变异、拷贝数变异、耐药突变和癌症细胞系基因组数据。使用前需要注册账号:学术用户可在 https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic/register 免费注册,商业用户需通过 QIAGEN 获取许可。Python 依赖通过 uv pip install requests pandas 安装。该技能提供 scripts/download_cosmic.py 脚本,支持命令行和函数调用两种方式下载数据,数据支持 GRCh38 和 GRCh37 两种参考基因组,文件格式包括 TSV/CSV(gzip 压缩)和 VCF。适用于癌症研究、精准医学、生物信息学流程集成等场景。