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更新于 10-30 00:12

数据与分析

17,181 个结果

cosmic-database

COSMIC Database 是一个用于访问 COSMIC(Catalogue of Somatic Mutations in Cancer,癌症体细胞突变目录)癌症突变数据库的技能。COSMIC 是探索人类癌症体细胞突变的最大、最全面的数据库,收录了数千种癌症类型中的数百万个突变、经过专家整理的癌症基因列表、突变特征以及临床注释。该技能支持以编程方式下载和查询癌症突变数据,包括体细胞突变、Cancer Gene Census、突变特征、基因融合、结构变异、拷贝数变异、耐药突变和癌症细胞系基因组数据。使用前需要注册账号:学术用户可在 https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic/register 免费注册,商业用户需通过 QIAGEN 获取许可。Python 依赖通过 uv pip install requests pandas 安装。该技能提供 scripts/download_cosmic.py 脚本,支持命令行和函数调用两种方式下载数据,数据支持 GRCh38 和 GRCh37 两种参考基因组,文件格式包括 TSV/CSV(gzip 压缩)和 VCF。适用于癌症研究、精准医学、生物信息学流程集成等场景。

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edgartools

edgartools 是一个 Python 库,用于访问、分析和提取美国 SEC EDGAR 系统中的申报文件(SEC filings)数据,可获取自 1994 年以来的全部 SEC 申报文件并进行结构化数据抽取。它支持按股票代码、CIK 编号或公司名称查找公司,获取 10-K、10-Q、8-K、Form 4、13F-HR、DEF 14A、SC 13D/G、Form D 等表格的申报文件,并提取财务报表(利润表、资产负债表、现金流量表)和 XBRL 数据。使用时须先通过 set_identity 设置身份信息以满足 SEC 的 API 访问要求。该工具适用于金融数据分析、财务研究及需要处理 SEC 申报文件的 AI 工作流,可通过 uv pip install edgartools 安装,AI/MCP 相关功能需安装 edgartools[ai]。

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kegg-database

KEGG Database 是一个通过 REST API 直接访问 KEGG(京都基因与基因组百科全书)的技能,仅限学术用途。它支持通路分析、基因-通路映射、代谢通路查询、药物相互作用检查以及 ID 转换等操作,主要面向 Python 环境。该技能提供 Python 辅助函数(scripts/kegg_api.py)和详细参考文档(references/kegg_reference.md),涵盖数据库信息查询、条目列表、关键词与分子属性搜索、条目检索、ID 转换、交叉引用和药物-药物相互作用等核心操作,并附带多种常见分析工作流。

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pdb-database

PDB Database 是一个用于访问 RCSB PDB(全球生物大分子三维结构数据库)的技能,支持通过文本、序列或结构相似性搜索蛋白质与核酸的三维结构,下载 PDB、mmCIF、BinaryCIF 等坐标文件,获取结构元数据、实验方法和质量指标,并可对多个结构进行批量操作。它基于官方 rcsb-api Python 客户端,提供 Search API 与 Data API 的统一访问,适用于药物发现、蛋白质工程、结构生物学研究以及教学可视化等场景。

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pubchem-database

PubChem Database 是一个用于查询 PubChem 化学数据库的技能,通过 PUG-REST API 和 PubChemPy 访问全球最大的免费化学数据库,涵盖 1.1 亿以上化合物和 2.7 亿以上生物活性数据。它支持按名称、CID、SMILES、InChI 或分子式检索化合物,获取分子量、LogP、TPSA、氢键供体/受体数量等分子属性,执行相似性搜索和子结构搜索,访问筛选实验的生物活性数据,并在 CID、SMILES、InChI 等化学标识符格式之间转换。该技能还支持批量处理多个化合物,用于类药性筛选或属性分析,并可下载 SDF、JSON、PNG 等结构文件。适用于化学信息学、药物发现和化合物数据分析等场景。

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uniprot-database

UniProt Database 是一个通过 REST API 直接访问 UniProt 的技能,用于蛋白质序列与功能信息的检索与分析。它支持按名称、基因、登录号或物种搜索蛋白质,以 FASTA 等格式获取序列,在 UniProt 与 Ensembl、RefSeq、PDB 等外部数据库之间进行 ID 映射,并访问 Swiss-Prot/TrEMBL 注释。该技能提供 Python 客户端脚本,封装搜索、单条获取、批量检索、ID 映射和流式下载等常用操作,适合生物信息学中的蛋白质查询与数据获取工作流。

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wc-fitness-eval

wc-fitness-eval 是一个用于评估 FIFA 世界杯梦幻足球(Fantasy)候选阵容或方案的技能,输出风险调整后、相对排名(rank-relative)的适应度分数。它依据指定的排名目标(protect 保护 / gain 追赶 / neutral 中性)计算适应度,公式由多项组成:raw_xEV(球员期望值之和加队长加成)、cs_corr_bonus(同队零封相关性加成)、progression_carry(深度球队球员未来轮次的折现价值)、ownership_leverage(基于持有率的排名项)、variance_term(方差项,随目标翻转符号)以及 feasibility_penalty(可行性惩罚)。该技能强调适应度必须多项目并存,禁止坍缩为单一指标,并强制输出完整分解结果。

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wc-fixture-progression

wc-fixture-progression 是一个用于赛事赛程难度与晋级概率分析的技能,主要服务于梦幻体育与赛事预测场景。它根据对手的 xGA(预期失球)和 xG(预期进球),分别从进攻与防守两个方向对每场比赛的难度进行 1-5 评分;通过参考类别基准率加贝叶斯更新,计算各队每轮比赛的晋级概率;标记强弱分明的错位比赛(mismatch),识别可产生廉价积分的机会;并生成难度转折日历,帮助在赛程变化前提前规划转会。该技能输出 fixture 信号,供下游技能消费,自身不重新估算对手实力或晋级概率。

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matlab-estimate-sar

该技能用于在 MATLAB Antenna Toolbox 中估算电磁场在介质组织体模内部的比吸收率(SAR)。技能面向射频与天线工程场景,支持三类方法:一是 birdcage + Phantom,使用鸟笼线圈配合体网格模型,可指定任意相对介电常数与损耗正切,适合 MRI SAR 分析;二是 conformalArray + shape.Custom3D,可将任意天线与介质头模一起放入求解器,适合手机等设备外部天线 SAR;三是直接使用 EHfields,在求解器不含组织的情况下于后处理阶段套用 SAR 公式,适合植入式天线。技能包含 SAR 计算公式、观测网格生成、功率归一化、质量平均 SAR(1g/10g)、功率平衡校验、可视化,以及法规限值参考(FCC 1.6 W/kg 每 1g,ICNIRP 2.0 W/kg 每 10g 等)。同时说明了介质目录与 LossTangent ≤ 0.03 的限制,以及组织属性参考数据。

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