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更新于 10-27 00:15

数据与分析

17,033 个结果

clinvar-database

ClinVar Database 是一个用于查询 NCBI ClinVar 数据库的技能,帮助用户检索人类遗传变异与表型之间的关系及临床意义。它支持按基因、位置、疾病或临床意义搜索变异,解读致病性分类(如致病、良性、意义未明 VUS),并通过 E-utilities API 或 FTP 批量获取数据。该技能还涵盖审查状态与星级评定、冲突解读处理、变异注释以及数据提交等内容,适用于临床遗传学研究和变异解读工作。

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vaex

Vaex 是一个面向超大规模表格数据的高性能 Python 库,采用惰性求值与核外(out-of-core)DataFrame 设计,可处理和分析超出可用内存的表格数据集。资料称其每秒可处理超过十亿行,支持对数十亿行数据进行交互式探索与分析。它适用于大于内存(从 GB 到 TB 级)的表格数据、对海量数据做快速统计聚合、为大数据创建可视化与热力图、在大数据上构建机器学习流水线、在 CSV、HDF5、Arrow、Parquet 等格式间转换,以及需要惰性求值和虚拟列以避免内存开销的场景,例如天文数据、金融时间序列等大规模科学数据。核心能力涵盖六个方面:DataFrame 与数据加载、数据处理与操作、性能与优化、数据可视化、机器学习集成、I/O 操作。典型用法是先通过 vaex.open 打开文件或从 pandas/NumPy 等创建 DataFrame,再用虚拟列、筛选与聚合进行计算,最后可视化或导出为 HDF5 等格式。

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