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更新于 10-23 00:13

数据与分析

16,811 个结果

petropy

PetroPy 是一个用于测井资料地层评价的 Python 库(此处配置版本为 PetroPy 0.1.6)。该技能从归一化后的 LAS 测井曲线出发,调用 Log.fluid_properties() 和 Log.multimineral_model() 完成流体性质计算与多矿物模型评价,用于获得经标定的孔隙度、含水饱和度、矿物组分等结果,可通过 write(...) 导出 LAS。它要求严格的输入契约:已准备的 GR_N、NPHI_N、RHOB_N、RESDEEP_N 曲线,深度为井面以下 TVD 英尺、严格递增且注明基准;不直接接受斜井 MD。需要经审查的配置(区间、流体参数、矿物端点与权重),示例配置仅供合成标定参考。缺失测量保持 NaN 并保留掩码,不将其视为零孔隙度或非产层。

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schema-exploration

该技能用于在回答 PostgreSQL 数据库的数据问题或编写 SQL 之前,先探索现有数据库结构。它强调从用户问题出发而非全库审计,使用已有数据库连接或提供的 schema 文件,并限定在用户授权的数据库与 schema 范围内。工作流包括确认当前数据库、服务器版本、角色与范围,选择相关 schema,读取匹配的表、分区/继承、外部表、视图、例程、触发器、安全/RLS 或扩展等参考信息,并通过注释、定义、键和已知依赖来印证含义。若用户需要 SQL,则先确定连接键与粒度,再在授权下用 EXPLAIN 验证只读查询。技能还给出安全与执行要求:优先结构目录查询,pg_stats 等数据派生信息需批准,未经授权不得更改 schema、数据、角色或会话设置,不得调用发现的函数、刷新物化视图或对未知查询运行 EXPLAIN ANALYZE,建议使用只读事务和合理语句超时,采样数据前需询问并设置明确限制。参考查询为纯 PostgreSQL SQL,目标版本为 PostgreSQL 18,并提示旧版本替代方案。

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alterlab-rnaseq-quant

该技能用于批量 RNA-seq 的转录本丰度定量:输入原始 FASTQ 读段与参考转录组,使用 salmon 2.x(Rust 重写版,选择性比对或 --sketch 模式)或 kallisto(v0.52.0,kb-python 工作流)生成转录本级丰度估计(counts + TPM),再通过 tximport/tximeta 汇总为基因级计数矩阵,并交给 alterlab-pydeseq2 做差异表达分析。它覆盖从原始数据到计数矩阵的流程,止于丰度矩阵,不调用差异基因、不处理单细胞条形码、不做变异检测。

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