用途:按严谨学术方法开展系统性、综合性文献综述,覆盖检索、筛选、数据提取、主题综合、引用核验与文档生成全流程。适用于研究或发表用的系统综述、meta 分析、范围综述、论文文献综述章节、领域现状调研与研究空白识别。
主要能力:以 parallel-web(parallel-cli search)为主检索工具,辅以 gget、bioservices、datacommons-client 等专业数据库技能;支持 PubMed/PMC、bioRxiv、arXiv、Semantic Scholar、ChEMBL、UniProt、KEGG、COSMIC、AlphaFold 等;提供去重、结果聚合、引用核验与 PDF 生成脚本。
使用方式:先规划研究问题(可用 PICO)、范围与检索策略,再用 parallel-cli search 做学术与通用检索,例如:parallel-cli search "your research topic" -q "keyword1" -q "keyword2" --json --max-results 10 --excerpt-max-chars-total 27000 --include-domains "scholar.google.com,arxiv.org,pubmed.ncbi.nlm.nih.gov,semanticscholar.org,biorxiv.org,medrxiv.org,ncbi.nlm.nih.gov,nature.com,science.org,ieee.org,acm.org,springer.com,wiley.com,cell.com,pnas.org,nih.gov" -o sources/litreview_<topic>-academic.json;用 parallel-cli extract 获取全文。筛选阶段用 python search_databases.py results.json --deduplicate --output unique_results.json 去重,并绘制 PRISMA 流程图。综合阶段复制模板:cp assets/review_template.md my_literature_review.md。核验引用:python scripts/verify_citations.py my_literature_review.md。生成 PDF:python scripts/generate_pdf.py my_literature_review.md --citation-style apa --output my_review.pdf。示意图生成:python scripts/generate_schematic.py "your diagram description" -o figures/output.png。
限制:资料未提供具体收费、价格、平台支持范围与效果保证;预印本未经同行评审需谨慎;部分数据库需 API key 或免费额度;引用样式与质量评估工具需按资料所述执行,缺失信息暂未提供。