该技能用于收集完整的生物靶点情报,采用 9 条并行研究路径,支持以基因符号、UniProt 登录号、Ensembl ID 或基因名指定靶点,并特别支持 GPCR 靶点检测。
主要原则包括:先创建报告文件再逐步填充;调用不熟悉的工具前用 get_tool_info 校验参数;按 T1–T4 对证据分级;每条事实附内联来源;所有章节必须存在并达到最低数据量,否则明确写“无数据”;先完成标识符消歧;记录阴性结果;文献检索考虑命名冲突;工具调用优先使用英文术语,回复使用用户语言。
工作流要求:先在 [TARGET]_target_report.md 初始化全部 14 个章节占位;数据返回后立即更新;方法学细节写入单独的 [TARGET]_methods_appendix.md。证据分级需出现在执行摘要、疾病关联、文献表与建议中。
9 条路径中,路径 0 始终最先执行,通过 Open Targets 多个接口填充疾病、可成药性、安全性、相互作用、GO、文献、小鼠模型、化学探针与相关药物等基础数据,并覆盖第 5、6、8、9、10、11 节。后续路径依次覆盖核心身份、结构与结构域、功能与通路、蛋白相互作用、表达谱、变异与疾病、药物相互作用、文献与研究。
结构搜索采用三步链:先取 UniProt 的 PDB 交叉引用,再做基于序列的相似结构搜索。GTEx 常需带版本号的 Ensembl ID,可先查询版本再拼接。已知参数修正包括:Reactome 映射使用 id、ensembl_get_xrefs 使用 id、OpenTargets 使用 camelCase 的 ensemblId、GTEx 需 gencode_id 加 operation="median"。
限制:资料未提供实际安装命令、运行环境与完整实现代码,具体可用性暂未提供。输出报告可能依赖外部工具接口的可用性与返回结果,阴性结果需显式记录为数据。