用途：面向基因集、蛋白与生物学过程，整合多个通路数据库进行通路富集、蛋白-通路映射、关键词检索和顶层通路浏览，形成系统层面的分析视图。
主要能力：阶段一用 Enrichr（如 KEGG_2021_Human、Reactome_2022）做基因列表的统计过表达分析；阶段二用 Reactome_map_uniprot_to_pathways 将 UniProt ID 映射到通路，并用 Reactome_get_pathway_reactions 取反应与子通路细节；阶段三用 kegg_search_pathway、kegg_get_pathway_info、WikiPathways_search、pc_search_pathways、biomodels_search 跨库按关键词检索；阶段四用 Reactome_list_top_pathways 提供物种顶层通路目录。
必要用法：核心输入为基因符号列表（如 ["TP53","BRCA1","EGFR"]）、UniProt 登录号（如 P53350）、关键词与物种（如 Homo sapiens）。注意参数名：Reactome 映射用 id 而非 uniprot_id；pc_search_pathways 需同时提供 action 与 keyword；Enrichr 用 gene_list 且区分大小写。富集默认以校正 p 值 < 0.05 为阈值，每通路至少 2 个输入基因，展示最显著的 10–20 条。
适用场景：差异表达/筛选结果的通路解释、蛋白功能调查、疾病或过程相关通路发现、跨库注释比较、SBML 计算模型查找。
限制：Reactome 人类覆盖强、非模式生物有限；KEGG 依赖关键词匹配，可能漏同义词；WikiPathways 策展质量不一；Pathway Commons 聚合可能重复；BioModels 对许多过程稀疏、常无结果；富集结果受通路大小与注释完整度影响，各库更新频率与响应结构不同，部分库存在速率限制。资料未提供安装命令、收费与具体部署方式。