用途
本技能面向系统性、可追溯的文献深度研究。它强调在检索前先做目标消歧，避免因命名或身份混淆而遗漏细节；通过证据分级区分可信结论与噪声；最终输出以内容为中心的详细报告，并强制包含完整性章节。
主要能力
- 目标消歧与画像：解析官方ID、同义词/别名及命名碰撞，获取蛋白长度、异构体、结构域、亚细胞定位、表达、GO术语与通路信息。
- 检索策略：高精度种子检索、引文网络扩展、过滤碰撞后的广泛检索、主题聚类与证据分级。
- 模式选择：完整深度研究模式与事实核查/验证模式，后者提供单页核查报告与关键论文的文献目录。
- 全文验证：三级策略，自动片段模式（Europe PMC）、手动两步（Semantic Scholar、ArXiv）、手动下载解析（回退）。
- 报告输出：默认交付报告文件，支持方法学附录，强制完整性清单校验。
- 来源可追溯：所有信息均标注来源数据库或工具。
- 英文优先检索：即使用户使用其他语言，检索词与工具调用仍使用英文，仅在英文无结果时回退原语种。
使用方式
- 澄清与模式选择：确认目标类型（生物靶点、主题或疾病）、范围（单一事实还是综合综述）、已知别名、约束条件，以及是否需要方法学附录，并据此选择模式。
- 目标消歧与画像：使用 UniProt、Ensembl、MyGene、InterPro、Human Protein Atlas、GTEx、GO、Reactome、KEGG、Open Targets 等工具建立规范身份、命名碰撞过滤方案、结构域、定位、表达与功能注释。
- 文献检索：高精度种子检索构建机制核心，随后进行引文网络扩展，并在过滤命名碰撞后做广泛检索，最后聚类主题并分级证据。
- 报告综合：将结果逐步写入 [topic]_report.md，执行完整性清单校验，形成生物学模型与可检验假设；按需生成 methods_appendix.md。
事实核查/验证模式的交付物包括：[topic]_factcheck_report.md（≤1页）与 [topic]_bibliography.json（+CSV）。其报告模板包含问题、答案与证据星级、来源、验证笔记与局限性。验证行为要求优先使用 ToolUniverse 文献工具（Europe PMC/PubMed/PMC/Semantic Scholar），尽可能使用全文片段验证，并且不添加论文未明确支持的额外结论。
适用场景
- 需要权威、可追溯结论的单一事实核查问题（例如某抗性菌株对哪种抗生素耐药）。
- 需要对某一靶点/主题进行系统综述与深度研究，并输出结构化报告。
- 存在命名碰撞风险（如 TRAG、CAT、JAK 等）的检索场景。
- 面向预印本（bioRxiv、medRxiv、ArXiv）或开放获取文献的深入分析。
- 需要方法学附录与完整证据链的研究交付。
限制
- 自动片段模式仅适用于带 fullTextXML 的开放获取文章，且仅限前3篇 OA 文章，Europe PMC 的 OA 覆盖约为 30–40%。
- 手动两步模式需要手动循环处理，速度较自动片段模式慢。
- 手动下载解析模式需要机构访问权限，无片段提取能力（返回完整 HTML），且质量因出版商而异，速度最慢。
- 引文工具存在失败情况，例如 NCBI elink 可能不稳定，需使用 Europe PMC 作为回退。
- 部分数据库与工具（如 UniProt、InterPro、GTEx、HPA、Open Targets、GO 等）的可用性依赖外部服务。
- 具体费用、价格、平台支持情况与效果表现：暂未提供。
工作流概览
用户查询 → 阶段0：澄清 + 模式选择（事实核查 vs 深度报告）→ 阶段1：目标消歧 + 画像（生物靶点默认开启）→ 阶段2：文献检索（内部方法学，不对外展示）→ 阶段3：报告综合（逐步写入 [topic]_report.md、完整性清单校验、生物学模型与可检验假设）→ 可选：methods_appendix.md（仅用户要求时）。