用途
该技能用于检索基因表达实验与多组学数据集，主要对接 ArrayExpress 和 BioStudies 两个数据库，适合需要查找公开表达谱数据、进行数据复用或整合分析的场景。它强调基因消歧与实验质量评估，并以结构化报告的形式呈现结果。
主要能力
- 查询澄清：当基因名有歧义（如 p53 指向 TP53 还是 MDM2 研究）、组织/条件不明确或未指定生物体时，会先向用户提问；对于明确的具体登录号（E-MTAB-、E-GEOD-、S-BSST*）、疾病/组织与生物体组合清晰的查询，或明确平台（RNA-seq、microarray）请求，则跳过澄清。
- 基因名解析与消歧：以基因检索时先解析官方标识符，如人类 HGNC、小鼠 MGI，记录常见别名以扩展搜索，并确认物种。
- 搜索与检索：调用 ArrayExpress 与 BioStudies 工具进行关键词/物种搜索，并获取实验详情、样本信息、可用文件与研究结构等元数据。提供回退链，例如 ArrayExpress 搜索为空时回退到 BioStudies 搜索，E-GEOD 可能有 BioStudies 镜像。
- 结构化报告：输出“数据集检索报告”，包含搜索摘要、数据质量概览、顶部实验详情（登录号、生物体、实验类型、平台、样本数、发布日期、实验设计、样本分组、可用数据文件、质量评估）以及多组学研究、汇总表、推荐建议与数据访问链接。
- 质量评估分级：分为高质量（●●●，≥3 个生物学重复、元数据完整、有处理后数据）、中等质量（●●○，2-3 个重复或部分元数据缺失、数据可获取）、低质量（●○○，无重复、元数据稀疏或数据访问有问题）、谨慎使用（○○○，单样本、无重复、平台过时），并要求附上评估理由。
- 完整性与错误处理：报告必须包含每项实验的必填字段、搜索摘要与推荐建议；即使为空也需包含多组学研究部分与数据整合说明。针对“未找到实验”“登录号未找到”“文件不可用”“API 超时”等情况给出对应处理方式。
使用方式
通过 ToolUniverse 加载工具后调用相关工具。典型调用包括：arrayexpress_search_experiments（关键词/物种搜索）、arrayexpress_get_experiment_details（完整元数据）、arrayexpress_get_experiment_files（下载链接）、arrayexpress_get_experiment_samples（样本注释）、biostudies_search_studies（多组学搜索）、biostudies_get_study_details（研究元数据）、biostudies_get_study_files（数据文件）、biostudies_get_study_sections（研究结构）。搜索参数方面，ArrayExpress 支持 keywords、species、array、limit；BioStudies 支持 query、limit。技能要求工具调用始终使用英文术语（基因名、组织名、条件描述），仅在英文无结果时回退使用原语言；回复则使用用户语言。
适用场景
包括疾病基因表达数据检索（如查找乳腺癌 RNA-seq 数据）、基因特异性研究检索（如查找小鼠 TP53 表达实验，可包含别名 p53）、具体登录号查询（如获取 E-MTAB-5214 详情）、多组学整合检索（如查找肝病的蛋白质组学与转录组学研究）。
限制
资料未提供该技能的收费、价格、平台支持范围、性能保证或具体数据库覆盖完整度等信息。部分研究可能限制数据下载，报告需注明“文件受提交者限制”。质量评估依赖元数据完整性与样本信息，可能受数据库记录质量影响。API 超时后仅重试一次，并可能标注“元数据检索不完整”。