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更新于 10-16 04:53

技能介绍

用途:面向治疗性抗体从临床前先导到候选分子的优化,涵盖序列人源化、结构建模、亲和力优化、可开发性评估、免疫原性预测及生产可行性判断。

主要能力与工作流分 8 个阶段:输入分析与表征(CDR/框架注释、种属与靶抗原识别、临床先例检索);人源化策略(IMGT 胚系比对、框架选择、CDR 移植、回复突变识别);结构建模与分析(AlphaFold 预测、CDR 构象与表位分析);亲和力优化(计算突变筛选、CDR 与界面改进);可开发性评估(聚集倾向、PTM 位点、稳定性与表达预测);免疫原性预测(IEDB MHC-II/T 细胞表位);生产可行性;最终报告与实验验证建议。

使用方式:技能要求先创建 antibody_optimization_report.md 报告并逐步更新,另输出 optimized_sequences.fasta、humanization_comparison.csv、developability_assessment.csv。调用工具包括 IMGT_search_genes、IMGT_get_sequence、SAbDab_search_structures、TheraSAbDab_search_by_target、AlphaFold_get_prediction、iedb_search_epitopes、iedb_search_bcell、UniProt_get_protein_by_accession、STRING_get_interactions、PubMed_search。工具调用使用英文术语,回复用用户语言。

适用场景:人源化小鼠抗体、亲和力优化、可开发性与免疫原性评估、双特异性工程、降低聚集、pH 依赖结合设计、CDR 分析与突变建议。

限制:资料未提供安装命令、收费价格、平台支持与具体准确度数据;结果为计算预测与评分,需实验验证;文档中的序列与评分示例仅作流程示意。