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literature_to_hypothesis

写作与研究

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更新于 10-16 03:37

技能介绍

用途:把科学文献中隐含或明确的假设提炼为结构化、可操作的形式。输入 5–50 篇 PubMed 文章、摘要或全文后,识别可检验的 if-then 命题,梳理支持与矛盾证据,并给出实验验证策略,输出 Markdown 报告,帮助研究者从文献综述转向假设驱动的实验设计。

主要能力:文献摄入与预处理,支持 PMID、DOI、摘要文本、全文 PDF/XML、RIS/BibTeX,经 PubMed E-utilities、pubmed-database 或 bioservices 获取,提取标题、摘要、关键词、MeSH 等并去重,主要支持英文;假设提取与形式化,区分明确、隐含、机制三类,统一写为“If 条件,then 结果,because 机制”,做可证伪性检查、范围界定与强度评分;证据合成,按支持/矛盾制表并分级;矛盾分析,检测冲突并给出调和假设;实验验证建议,含设计、可行性、优先级与证伪标准;输出 Markdown/HTML/JSON 报告,含执行摘要、假设、矛盾矩阵、验证路线图与来源。

必要用法:以 pmids、pdf_paths、topic、output、max_hypotheses、include_validation、focus、output_format、prioritize 等字段配置任务。示例:pmids 列表加 topic 与 output 生成假设报告;focus 设为 contradictions 做矛盾合成;pdf_paths 加 prioritize 为 validation 输出验证路线图。hypothesis-generation、hypogenic 等为下游或配套组件。

适用场景:从文献中系统提取假设、缺口分析与验证规划、矛盾综合、基金申请、系统综述延伸、机制假设生成、跨领域整合,以及教学训练。

限制:非英文摘要会被标记,机器翻译有准确性风险;PDF 全文经 markitdown 提取;可行性评估为粗略判断;需专用设备或长周期实验会被标注;具体收费、价格、平台可用性等暂未提供。