用途：AnnData 用于存储、操作和分析带注释的数据矩阵，常用于单细胞分析，可作为 scverse 生态的基础数据结构。
主要能力：核心组件包括 X、obs、var、layers、obsm、varm、obsp、varp、uns、raw；支持读写 h5ad、zarr、CSV、MTX、Loom、10X、Excel 等格式；支持备份模式处理大文件、云端访问、稀疏矩阵、字符串转分类；可按观测或变量拼接多个对象，支持 inner/outer 连接与 AnnCollection 惰性拼接；支持子集、筛选、转置、复制与视图、重命名、类型转换、排序与质控过滤；可结合 scanpy、muon、scvi-tools 等使用，并通过 AnnLoader 对接 PyTorch。
使用方式：安装命令为 uv pip install anndata，可选依赖为 uv pip install anndata[dev,test,doc]。读取可用 ad.read_h5ad('data.h5ad')，大文件可加 backed='r'；写入可用 adata.write_h5ad('output.h5ad')；拼接可用 ad.concat([...], axis=0, join='inner', label='batch', keys=[...])；转换可用 adata.strings_to_categoricals()。
适用场景：单细胞 RNA 测序分析、多批次整合、多模态数据、大文件处理、与 scverse 工具集成。
限制与注意：外部数据需按索引对齐；内存不足时可使用备份模式或稀疏矩阵；处理大文件读取较慢时可使用压缩或 zarr。官方文档 https://anndata.readthedocs.io/，GitHub https://github.com/scverse/anndata。