该技能用于设计本体与知识图谱，以建模研究领域知识，覆盖本体工程方法、OWL 与 RDF 基础、复用现有本体，以及构建、验证、查询知识图谱的实用工具。
用途与概念：本体是共享概念化的形式化、显式规范，定义类（如 Gene、Disease、Drug）、属性（如 causes、treats）、个体（如 TP53、Breast Cancer）和公理（规则与约束，如每种 Drug 恰有一个分子式）。在研究中的目的包括：跨研究组统一术语、支持异构数据集成、支撑自动推理、通过图查询促进知识发现、提供机器可读领域模型。区分：分类法仅含层级 is-a 关系；本体含类、属性与公理并支持推理；知识图谱是填充了实例数据的本体，由数百万条（主语, 谓词, 宾语）三元组构成。
本体工程流程：1) 定义范围与能力问题；2) 搜索并复用现有本体，资源包括 BioPortal、Linked Open Vocabularies、OBO Foundry、Schema.org；3) 与领域专家头脑风暴、查阅文献，列出关键术语与关系；4) 用 Protege、WebVOWL、TopBraid Composer 等工具定义类层次与属性；5) 用 OWL/RDF 编码公理与约束；6) 用 SPARQL 查询、推理机（HermiT、Pellet）、单元测试对照能力问题与真实数据验证；7) 以持久 URI 和文档发布，推荐 w3id.org 或 purl.org。
RDF 与 OWL 基础：RDF 以（主语, 谓词, 宾语）三元组表示知识，序列化格式包括 Turtle(.ttl)、JSON-LD(.jsonld)、RDF/XML(.rdf)、N-Triples(.nt)。Turtle 中可用 @prefix 声明命名空间，以 owl:Class、owl:ObjectProperty、rdfs:domain/rdfs:range、rdfs:label 等定义类、属性、定义域值域与标签。
查询：可用 SPARQL 编写查询，例如查找与某疾病关联的基因、查找治疗某基因关联疾病的药物、按基因统计关联疾病数（可用 GROUP BY 与 ORDER BY）。
工具：Protege（桌面 IDE，完整本体开发与推理）、WebVOWL（网页可视化）、RDFLib（Python 库，程序化 RDF 操作）、Apache Jena（SPARQL 端点与推理框架）、Neo4j（属性图数据库，非 RDF）、Blazegraph/GraphDB（三元组存储，存储与查询 RDF 数据）。
设计原则：发布时遵循 FAIR 原则；优先复用既有本体术语；为每个类与属性记录标签、定义与示例；用推理机检查逻辑一致性；对本体进行版本管理并维护变更日志；在持久 URI 上同时发布人类可读文档（HTML）与机器可读文件（OWL/TTL）。
限制：资料未提供价格、收费、平台支持范围或具体效果数据。