用途：在宿主仓库内运行，检测仓库事实并映射到每个已安装技能的 config.json 配置模式，写出准确的配置，同时不覆盖人工故意设置的值。仅在其 config.example.json 键集合内做对账；preflight 自检测基础分支与工作区、读取根目录可选的 preflight.config.json，故跳过。
主要能力：先预演后写入，幂等；按键名对每个键三向比较，状态包括 inferred（写入检测值）、unchanged（无操作）、drift（保留并同时报告检测值）、needs-manual-input、manual-kept、unknown-kept。可选择安装完整技能目录（Rheged ship set 加 Matt Pocock 包）： node <skills-dir>/rheged-skills-setup/scripts/initialise.mjs --install --write 先单独用 --install 预览。还会处理宿主仓库根 .gitignore（preflight 的 .preflight-summary.json 追加忽略、剥离消费者中错误的 .claude/skills/*/config.json 忽略规则），并生成提交的 .claude/skills.lock 记录已装技能版本与来源。
使用方式：从仓库根预演： node <skills-dir>/rheged-skills-setup/scripts/initialise.mjs --dry-run --json 按 needs-manual-input 收集 facts（如 Linear 相关键、lockSource/lockRef），确认前检查 CLAUDE_CODE_OAUTH_TOKEN，展示差异后以 --write 并传入 stdin JSON 写入；之后再次预演确认幂等。只读审查配置： node <skills-dir>/rheged-skills-setup/scripts/initialise.mjs --review （加 --json 输出机器可读结果，只读不写盘）。
适用场景：需要为多个共享智能体技能统一、可重复地生成配置，并检测哪些仓库落后于已装版本的团队仓库。
限制：仅对账模板已知键；部分值需人工提供；不校验 Claude GitHub App 是否安装；缺失信息不编造，source/ref 未提供时写为 null 并在报告中标记。