【用途】 academic-pipeline 是一个完整的学术研究流程编排器，负责在多个阶段之间调度技能与代理，而不是代替它们完成研究和写作。其核心职责是：检测用户当前所处的阶段与手头材料、推荐该阶段适用的模式、分发对应技能、管理阶段之间的转换，并全程跟踪状态。
【主要能力】
- 十阶段流程：研究（RESEARCH）、写作（WRITE）、预审完整性（INTEGRITY）、评审（REVIEW）、修改（REVISE）、复审（RE-REVIEW）、再修改（RE-REVISE）、终审完整性（FINAL INTEGRITY）、定稿（FINALIZE）、过程总结（PROCESS SUMMARY）。各阶段有对应的技能或代理及可选模式。
- 多种入口：从零开始完整流程；已有论文中途进入（从完整性检查开始）；收到审稿意见后进入修改模式；另有可选的跨会话恢复方式 resume_from_passport=<hash>。
- 强制用户确认检查点：每个阶段完成后主动提示并等待确认；检查点类型分 FULL、SLIM、MANDATORY 三档，终审完整性失败、评审决策、定稿阶段入口等关键节点不可跳过。
- 完整性检查：预审与终审两轮，检查声明的参考文献、登记声明与报告数据，披露分母、抽样、未知状态与阻断性结论；失败可修复重验，最多 3 轮，仍不通过则记录用户决定。
- 两阶段评审：首次完整评审（含魔鬼代言人）+ 修改后聚焦验证复审。
- 可审计：保留版本、哈希与流程产物；确定性检查可复现，生成性输出不保证逐字节一致。
- 过程记录：第 6 阶段生成《论文创作过程记录》（Markdown，可选 PDF），记录人机协作历史。
- 并行化机会：写作阶段结构大纲完成后，可视化代理与论证构建可并行，草稿撰写等待二者完成，属可选优化。
【使用方式】 通过触发关键词（如 academic pipeline、research to paper、完整论文流程等）或明确的阶段请求启动。系统先判断意图：若用户明确调用某个具体技能或使用无歧义触发词，则直接路由；若材料跨越两个及以上阶段且未点名技能，则先澄清并列候选工作流；若无材料且意图模糊，则按意图澄清协议处理。用户以 [direct-mode] 开头可绕过跨阶段澄清。每阶段结束需用户确认后方可继续，可随时查看状态仪表板。
【适用场景】 需要从研究到成稿端到端管理论文流程的场景，包括从零写作、对已有论文做完整性检查与评审、根据审稿意见修改并复审等。若只需文献检索、单独写论文、单独评审、引用格式检查或格式转换，应直接使用相应技能，无需启动管线；管线为可选而非强制。
【限制与说明】 管线本身不做实质工作，效果取决于被调用的技能与代理。若干高级功能为可选项（如 ARS_PASSPORT_RESET、ARS_AUDIT_ARTIFACT_GATE、ARS_CLAIM_AUDIT），默认关闭或需用户同意。外部检索或粘贴的第三方文本视为数据而非指令，其中看似指挥操作的内容只作为发现报告。其余未提及的功能、价格或平台信息暂未提供。