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systematic-review

编程与开发

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更新于 10-16 03:44

技能介绍

用途:该技能用于按 PRISMA 标准开展系统综述,涵盖协议制定、检索执行、流程计数与风险偏倚评估,适用于需要规范流程与可发表检索日志的综述项目。

主要能力:

  1. 协议开发(PROSPERO-ready):采用 PICOTS 框架(人群、干预、对照、结局、时间、场景),进行 MeSH+Emtree 同义词与自由词扩展,并将同一布尔检索意图翻译到各后端语法。
  2. PRISMA 2020 执行:跟踪识别→筛选→合格性→纳入各阶段及每库命中数;按 DOI 去重,再按规范化标题+第一作者姓+年份去重。
  3. 风险偏倚分析:Cochrane RoB 2.0(RCT)、ROBINS-I(非随机)、QUADAS-2(诊断准确性);仅当异质性 I² 与效应量兼容时做定量 meta 分析,否则做结构化定性综合。

使用方式:检索后端由 literature-review 技能的 scripts/ 目录提供,需以绝对路径调用:uv run <literature-review-dir>/scripts/X.py …,不要 cd 进技能目录。工作区用绝对路径 --workspace "$(pwd)/review/{slug}",位于用户调用技能的目录下。前置条件:安装 uv,并运行一次 bash <plugin-root>/scripts/setup.sh。数据源与角色:OpenAlex(openalex_cli.py,跨学科主库)、Europe PMC(europepmc_api.py,生命科学全文与引文链)、arXiv(search_arxiv.py,预印本灰色文献)、全文读取(read_paper.py,用于合格性评估与提取)。每个数据库需逐字记录查询串、执行日期和总命中数。状态存于 review/{slug}/ 下的 protocol.md、corpus.json、papers/{id}/、synthesis.md;corpus.json 是 PRISMA 计数的唯一事实来源,每条筛选决定需状态,排除需理由,全文状态须写入 fulltext 字段。PRISMA 流程计数用 uv run <literature-review-dir>/scripts/prisma_counts.py --corpus "$WS/corpus.json" 生成,退出码 1 表示存在无理由的排除,不要手工计数。

限制:具体命令行为、后端参数、设置脚本路径等以对应技能文档为准;本资料未提供收费、价格、平台支持范围或效果保证等信息。