opentargets-database

该技能面向药物靶点发现与评估，通过 Python 辅助函数调用 Open Targets Platform 的 GraphQL API，系统检索靶点—疾病关联及其证据。主要能力包括：按基因符号、疾病名或药物名检索实体标识符；获取靶点注释（可成药性、安全性风险、遗传约束、疾病关联）；获取疾病信息与相关靶点；检索特定靶点—疾病对的多类证据（遗传关联、体细胞突变、已知药物、通路、RNA 表达、动物模型、文献）；查找疾病相关已知药物及其机制、临床试验阶段与状态；获取药物详情（类型、机制、适应症、撤市信息）；按分数筛选靶点的全部疾病关联。使用方式：导入 scripts/query_opentargets.py 中的函数，如 search_entities、get_target_info、get_disease_info、get_target_disease_evidence、get_known_drugs_for_disease、get_drug_info、get_target_associations、execute_query。标识符约定：靶点用 Ensembl 基因 ID，疾病用 EFO ID，药物用 ChEMBL ID。API 端点 https://api.platform.opentargets.org/api/v4/graphql，无需认证。适用场景包括靶点发现与验证、证据收集、药物重定位、竞争情报、机制研究、生物标志物发现与安全性评估。限制：关联分数为相对排序指标而非临床成功预测；研究较少的疾病分数偏低；证据质量不一，需结合生物学与临床背景解读；系统性分析建议使用数据下载或 BigQuery；平台按季度更新，引用需遵循其要求。