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写作与研究

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更新于 10-16 09:49

技能介绍

用途:该技能面向系统性、全面的文献综述工作,适用于研究或发表前的证据汇总、特定主题知识综合、meta 分析或范围综述、论文或学位论文的文献综述章节写作,以及领域研究现状与空白调研。

主要能力:整合多个科学技能访问数据库,包括 gget(PubMed、bioRxiv、COSMIC、AlphaFold、Ensembl、UniProt)、bioservices(ChEMBL、KEGG、Reactome、UniProt、PubChem)及 datacommons-client;支持通过直接 API 检索 arXiv、Semantic Scholar。内置引用校验、结果聚合与文档生成工具,遵循 PICO 框架、PRISMA 流程图、质量评估工具(Cochrane、Newcastle-Ottawa、AMSTAR 2)等方法学要求。

使用方式:整体流程分七阶段:规划与界定、多库检索、筛选、数据提取与质量评估、综合分析与写作、引用校验、文档生成。常用命令包括:聚合结果 python scripts/search_databases.py combined_results.json --deduplicate --format markdown --output aggregated_results.md;校验引用 python scripts/verify_citations.py my_literature_review.md;生成 PDF python scripts/generate_pdf.py my_literature_review.md --citation-style apa --output my_review.pdf。数据库检索如 gget search pubmed "CRISPR gene editing" -l 100、gget search biorxiv "CRISPR sickle cell" -l 50。模板可复制 cp assets/review_template.md my_literature_review.md。

适用场景:生物医学、生命科学及跨学科的系统综述与范围综述;需验证引用并具备专业排版的学术写作;研究空白识别。

限制:预印本未经同行评审需谨慎;Semantic Scholar API 可能需密钥;检索日期与结果数须记录以保证可复现;PDF 生成依赖 pandoc/xelatex。具体价格与平台支持暂未提供。