用途:OpenBio 技能用于通过 API 访问生物数据库并调用计算生物学工具,覆盖蛋白质结构、文献检索、基因组与变异、序列相似性搜索、化学信息学、分子生物学、质粒分析、通路分析、临床与药物数据以及结构预测等场景。
主要能力:提供多类工具,包括 fetch_pdb_metadata、get_alphafold_prediction 等蛋白结构工具,search_pubmed、arxiv_search 等文献工具,lookup_gene、vep_predict 等基因组工具,submit_blast 等序列比对工具,calculate_molecular_properties 等化学信息学工具,design_primers、assemble_gibson 等分子生物学工具,parse_plasmid_file、edit_plasmid 等质粒工具,以及 submit_boltz_prediction、submit_proteinmpnn_prediction 等结构预测工具,还有 KEGG、Reactome、STRING、g:Profiler 等通路分析工具和 ClinicalTrials、ClinVar 等临床数据工具。
使用方式:先安装技能,命令为 bunx skills add https://github.com/openbio-ai/skills --skill openbio。需设置环境变量 OPENBIO_API_KEY,密钥在 http://openbio.tech/profile#apikeys 创建。调用前建议先做版本检查与健康检查,并始终先获取工具 schema,再校验参数、调用工具;长时间任务需轮询 job 状态获取结果。
限制:所有工具调用需要 API 密钥;部分预测任务为长时间运行,必须轮询;参数名称因工具而异,需先查 schema;资料未提供具体价格、免费额度或平台支持范围。