pride-skill

用途：通过统一脚本访问 PRIDE Archive API，进行蛋白质组学项目发现与项目级元数据查询。主要能力：调用 REST 接口，优先使用 projects 路径做项目发现，使用 projects/<PXD accession> 做项目级元数据查询，可控制分页规模，输出简洁的 Markdown 摘要，或在用户明确要求时返回原始 JSON。使用方式：所有 PRIDE Archive 调用都使用 scripts/rest_request.py，base_url 固定为 https://www.ebi.ac.uk/pride/ws/archive/v2，从 stdin 读取一个 JSON 对象，必填字段为 base_url、path，可选字段包括 method、params、headers、json_body、form_body、record_path、response_format、max_items、max_depth、timeout_sec、save_raw、raw_output_path。示例命令：echo '{"base_url":"https://www.ebi.ac.uk/pride/ws/archive/v2","path":"projects","params":{"keyword":"proteomics","pageSize":10},"max_items":10}' | python scripts/rest_request.py。输出：成功时返回 ok、source、path、method、status_code、warnings 以及紧凑记录或摘要；失败时返回 ok=false 及 error.code、error.message；save_raw=true 时使用 raw_output_path。限制：资料未提供更多运行环境、依赖版本、配额、认证或错误处理细节；资料建议在长对话中重新发起请求，不要依赖旧的工具输出。