用途：对已预处理并带注释的单细胞 AnnData（常见髓系/造血谱系）拟合 Monocle2 风格轨迹，含 DDRTree 排序、拟时序计算、分支点检测、沿拟时序的逐基因差异检验及 BEAM 分支依赖表达建模，并用 OmicVerse 统一绘图接口展示结果。Monocle 是原 Monocle2 逻辑在 Python 中的重实现，操作 AnnData 而非 cell_data_set；dynamic_features 为各轨迹技能共用的 GAM 后端，使沿拟时序的可视化可互通。
主要能力：mono.preprocess() 做方差稳定化标准化；mono.select_ordering_genes(max_genes=1000) 生成 use_for_ordering 掩码；mono.plot_ordering_genes() 诊断图；mono.reduce_dimension(max_components=4) 生成 obsm['X_DDRTree']；mono.order_cells(root_by_column='subtype', root_by_value='Lsk') 写入 Pseudotime 与 State；mono.differential_gene_test(cores=-1) 返回 pval、qval、status；mono.BEAM(branch_point=1, cores=-1) 做分支依赖基因检验。绘图用 ov.pl.trajectory/trajectory_overlay/trajectory_tree（method='monocle'）、ov.pl.branch_streamplot、ov.pl.dynamic_heatmap、ov.pl.dynamic_trends，趋势拟合用 ov.single.dynamic_features。
使用方式：加载 AnnData 后依次 preprocess、select_ordering_genes、reduce_dimension、order_cells，按需运行差异检验与 BEAM，再绘图。做差异检验前可在排序基因子集上重建 Monocle 以提速。dynamic_features 支持 groupby/groups 实现分支比较，配合 compare_groups、split_time、shared_trunk 绘制共享主干的分支趋势；分布默认 normal/identity，适用于对数标准化表达。
适用场景：造血等谱系的拟时序排序、沿时间变化的基因趋势、分支依赖基因发现与拟时序可视化。
限制：仅限本技能范围，Diffusion/Slingshot/Palantir、VIA、scTour、CellRank 及多模态轨迹推断属其他技能；不含预处理、聚类与注释。需提供含计数或对数计数的 AnnData，并带用于分组与着色的细胞类型列；Pseudotime、State 会被写入覆盖。未提供官方文档、安装命令或具体版本信息。