用途：对用户提供的骨架 PDB 执行 ProteinMPNN 逆折叠，生成候选蛋白序列并给出对应分数，适用于为给定主链做序列设计的第一轮尝试。
主要能力：可通过 scripts/design.py 提交设计请求，支持指定序列条数、温度、链、排除氨基酸、可溶模型、CA-only 模型与随机种子等控制；输出 designed_sequences.fa、summary.json、request.json、response.raw、response.json，FASTA 保留完整返回的 mfasta（含原生/WT 条目），summary 只含设计序列及实际分数。
使用方式：客户端从环境读取 NIM_API_MODE、PROTEINMPNN_NIM_URL，托管模式下还需 NGC_API_KEY。托管端点 https://health.api.nvidia.com/v1/biology/ipd/proteinmpnn/predict 需 Authorization: Bearer $NGC_API_KEY；本地模式在 PROTEINMPNN_NIM_URL 后追加 /biology/ipd/proteinmpnn/predict，默认 http://localhost:8000，本地推理不发认证头。示例：python scripts/design.py --mode hosted --pdb /path/to/backbone.pdb --num-sequences 10 --temperature 0.1 --output-dir /path/to/new-design-run；--chains A、--omit-aas C、--soluble、--seed、--ca-only 可按需添加。本地 Docker 需完整执行预检、docker login、docker run（nvcr.io/nim/ipd/proteinmpnn:latest）与就绪轮询，缓存挂载为 /home/nvs/.cache/nim；就绪检查：proteinmpnn_nim_url="${PROTEINMPNN_NIM_URL:-http://localhost:8000}"; until curl -sf "${proteinmpnn_nim_url%/}/v1/health/ready"; do sleep 5; done。
限制：托管模式会上传整个 PDB 与参数，需用户明确确认，机密结构建议本地 NIM。最低 GPU 显存约 3 GB；sampling_temp 必须为列表；mfasta 为空需检查 input_pdb 非空且 num_seq_per_target ≥ 1；本地 URL 出现 404 通常是误加 /v1/ 前缀。请求失败应报告失败与诊断路径，不得替换示例序列或重复提交。分数不能证明序列会折叠或结合，除非实际运行，否则未做折叠回验；Boltz2 或 OpenFold3 验证为可选的后续步骤。未提供的收费、价格与平台细节暂未提供。