SuperAPI AI 工具集

boltz2-nim

通用与其它

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更新于 10-16 07:24

技能介绍

用途:Boltz2 NIM 用于生物分子结构预测和可选配体结合亲和力预测,可处理蛋白质、蛋白质-配体、DNA/RNA 复合物。

主要能力:输入蛋白质序列、DNA/RNA 聚合物、SMILES 或 CCD 配体,输出 mmCIF 结构;可对单个配体开启 predict_affinity,报告 affinity_pic50、affinity_pred_value、affinity_probability_binary。支持预计算 A3M MSA、模板与采样参数调整。

使用方式:托管 NVIDIA API 地址 https://health.api.nvidia.com/v1/biology/mit/boltz2/predict,需 Authorization: Bearer $NGC_API_KEY;本地地址 http://localhost:8000/biology/mit/boltz2/predict,本地推理无需鉴权头。本地 Docker 启动使用 nvcr.io/nim/mit/boltz2:1.6.0,需 --gpus all、--shm-size=16G 和 ${LOCAL_NIM_CACHE}:/opt/nim/.cache 挂载,首启下载约 30 GB 权重。就绪检查为 until curl -sf http://localhost:8000/v1/health/ready; do sleep 5; done。

限制:每请求最多 12 个聚合物、20 个配体,链长上限 4096 残基;亲和力预测每请求仅支持一个配体且增加运行时间;422 表示序列、CCD/SMILES、MSA 格式错误或多配体亲和力。凭据仅从环境读取,避免在输出和日志中泄露密钥。其余细节暂未提供。