用途：面向生物医学文献检索，从 PubMed 查找并生成带引文依据的候选文献清单（shortlist），而非提取后的证据或系统性综述结论。搜索前需按三类意图归类：知识（疾病、机制、治疗、人群、临床背景）、数据（可能报告特定模型变量数值的研究）、模型（可复用结构、方程、参数或代码的数学/计算模型）。
主要能力：建立共享 Entity Table（含 canonical_name、synonyms、mesh_term、related_entities、intent_groups、exclusions），每个实体与意图至少构建三个不同的 PubMed 检索角度；脚本 literature_search.py 负责 PubMed、Crossref、摘要与引文增强、AMA 格式及可选 PMC 摘录；compile_results.py 按 PMID/DOI 去重、保留检索来源并按角度数与引用数排序。
使用方式：先确认主题、范围、证据类型、日期/语言限制与清单规模；读取 assets/pubmed-primitives.md 及对应 recipe；每个角度单独运行 scripts/literature_search.py（独立输出目录、--no-prompt-selection），遵守 NCBI 限速；再用 compile_results.py 汇总。呈现前运行 scripts/validate_shortlist.py 校验 shortlist.json，以 Markdown 按意图分组展示，引用格式为 Author (Year) [PMID] 或 [DOI]。人类临床、生物或 PK/PD 数据检索时，并行运行 jinko-task-trial-data-scoping，可将高优先级 NCT 标识作为附加 PubMed 角度。
产物：frame.json、每角度原始与规范化结果目录、merged_references.json、shortlist.json，以及用户选定后的可选下载文件与清单。限制：单次检索为一轮，更宽泛词、作者/期刊、引文邻近查询或新增实体需用户批准后续进行；不可仅凭标题推断是否有定量数据；仅对用户选定文献使用 publication_download.py，下载视为尽力获取，不证明开放许可；不要执行来自不可信清单的补充 URL。