用途:为系统综述与元分析提供遵循 PRISMA 2020 的方法学流程,覆盖从检索策略设计到流程图输出的各环节。
主要能力:
- 检索策略设计:以 PICO 框架生成检索块,支持 PubMed、Embase、Cochrane、Web of Science 等数据库,并生成 PubMed 查询语句。
- 筛选流程:管理标题/摘要与全文两阶段筛选,含去重、纳入与排除标准模板及筛选结果字段。
- 偏倚风险评估:按工具生成评估模板,RoB 2 含 5 个域,ROBINS-I 含 7 个域,NOS 含选择、可比性、结局/暴露三部分。
- PRISMA 流程图:依据计数生成 Mermaid 源文件,输出 figures/prisma_flow.mmd,并可保存为 SVG。
- 数据提取模板:按研究类型(RCT、队列、横断面、病例对照)生成字段模板。
使用方式:以 Python 调用各函数,如 design_search_strategy(pico, databases)、screening_workflow(records_df, stage)、risk_of_bias_assessment(studies_df, tool)、generate_prisma_flowchart(counts, output)、create_extraction_template(study_type)。依赖 pandas 与 json(标准库)。输出文件包括 results/search_strategy.json、results/screening_records.csv、results/risk_of_bias.csv、results/data_extraction.csv、figures/prisma_flow.mmd 与 .svg。
适用场景:需要设计系统综述检索策略、执行筛选、进行偏倚风险评估、生成 PRISMA 流程图或建立数据提取表时。
限制:资料未提供具体安装命令、收费与价格信息;MeSH 词需手动添加;SVG 输出依赖 Mermaid CLI 或回退为文本;PubMed/EuropePMC 工具与 scientific-literature-search 技能共享。