用途：面向免疫情报学分析，提供从表位预测到疫苗候选排序的系统化流程。适用于预测肽-MHC结合亲和力、识别T细胞/B细胞表位、分析TCR/BCR免疫库（克隆型）多样性、抗体CDR环结构建模、疫苗候选抗原优先级排序。
主要能力：MHC-I结合预测（示例用mhcflurry的Class1PresentationPredictor，输出亲和力nM、百分位排名、加工与呈递分数，按<50 nM强结合、<500 nM弱结合分级）；B细胞线性表位预测（结合亲水性、柔性等打分，窗口与阈值可调）；TCR/BCR免疫库多样性分析（Shannon熵、Simpson指数、克隆性、Chao1、Gini等指标）；抗体可变区结构分析（ANARCI编号IMGT/Kabat/Chothia，提取CDR-H1/H2/H3、CDR-L1/L2/L3）；疫苗候选多准则排序（抗原性、MHC覆盖、保守性、表面可及性、非致敏性、非毒性加权合成分）。
使用方式：以Python脚本/函数形式调用，示例依赖mhcflurry、anarci、biopython、immcantation、scirpy等包。MHC预测调用predict_mhc_binding(peptides, alleles, method)；B细胞表位用predict_bcell_epitopes(sequence, window_size, threshold)；免疫库分析用repertoire_analysis(clonotype_df, chain, clone_col, count_col)；抗体分析用antibody_structure_analysis(vh_seq, vl_seq, numbering)；疫苗排序用vaccine_candidate_ranking(antigens_df, weights)。输出文件包括results目录下CSV/JSON与figures目录下PNG（如mhc_binding_predictions.csv、repertoire_diversity.json、epitope_map.png等）。
外部工具：经ToolUniverse SMCP可调用IEDB（表位、表位-MHC、B细胞、MHC等位、抗原搜索）、IMGT（免疫基因信息/序列/检索）、SAbDab与TheraSAbDab（抗体结构、治疗性抗体及按靶点检索）、UniProt（条目获取）。可与scientific-sequence-analysis、scientific-protein-structure-analysis、scientific-protein-design、scientific-variant-interpretation、scientific-single-cell-genomics等技能协同。
限制：部分实现为示意（如SHM率估计需生殖系列数据库）；阈值、权重等参数需按研究场景调整；外部数据库与工具的实际可用性、版本及许可资料未提供；未提供收费、平台支持或性能验证信息。