用途：将学术 PDF 转换为干净的 Markdown，便于以文本方式阅读、分析或引用论文。支持本地 PDF 文件与直接指向 PDF 的远程 URL。
主要能力与用法：通过 uvx 运行，无需安装。基本命令为 uvx paper-siphon paper.pdf；远程示例 uvx paper-siphon https://arxiv.org/pdf/1706.03762.pdf；自定义输出 uvx paper-siphon paper.pdf -o paper-notes.md。默认输出为与输入同名的 .md 文件。
提取管线：默认管线基于 Docling，适合多数标准单栏/双栏文本、简单表格、无大量数学的论文，速度最快，会剥离页边行号并规范化空白。--vlm 使用视觉语言模型直接解读页面图像，适合复杂版式、图文交错、扫描件或默认输出乱码的情况，速度明显更慢；在 Apple Silicon 上自动使用 MLX 加速，可用 --no-mlx 关闭，或用 uvx --with 'paper-siphon[mlx]' paper-siphon --vlm paper.pdf 显式包含 MLX 依赖。--enrich-formula 对默认管线提取的数学表达式做后处理以提升保真度，但资源消耗大；数学密集的论文更推荐 --vlm，因为默认管线常丢失展示公式。
其他选项：-o/--output 指定输出路径，--mlx/--no-mlx 控制 MLX 加速，-v/--verbose 输出调试日志。arXiv 需使用 /pdf/ 链接而非 /abs/。可批量转换：for f in papers/*.pdf; do uvx paper-siphon "$f"; done。
限制：默认管线对数学与复杂版式效果有限；--vlm 较慢；--enrich-formula 资源密集。建议先用默认管线，输出乱码或不完整或论文数学密集时再升级到 --vlm。