用途：从 NCBI、Ensembl、UniProt 检索、注释并比较生物序列，覆盖核苷酸搜索、序列获取、基因摘要、直系同源发现与蛋白序列提取；当数据目录含 FASTQ 且问题涉及 Trimmomatic、BWA、samtools、FastQC 或覆盖深度时，本技能作为入口，但实际工作为 shell 层面。
主要能力与用法：先做基因 ID 解析，再检索核苷酸、获取蛋白序列、查找直系同源。常用工具包括 NCBIGene_search（term 需用 "TP53[Symbol] AND Homo sapiens[Organism]" 格式）、NCBIGene_get_summary、NCBI_search_nucleotide、NCBI_fetch_accessions（参数为 uids 而非 accessions）、NCBI_get_sequence、EnsemblSeq_get_region_sequence、ensembl_get_sequence、UniProt_get_sequence_by_accession（返回键为 result 而非 data）、NCBIDatasets_get_orthologs（需数字 NCBI Gene ID）、EnsemblCompara_get_orthologues、InterPro_get_entries_for_protein、Pfam_get_protein_annotations、BLAST_protein_search、EBI_pairwise_align、EBI_translate_sequence、EnsemblVEP_annotate_hgvs、ClinVar_search_variants、PubMed_search_articles。
关键规则：优先检查预计算结果（_executed.ipynb、results、analysis.R 等），存在则直接读取或执行，不要从原始数据重跑。Trimmomatic 中“reads completely discarded”须按 F + R + 2D 逐样本求和，不能只报 Dropped（Dropped 计的是配对）。覆盖深度用 samtools depth -a 再求平均。残基计数、GC%、反向互补等应运行附带脚本（biology_facts.py、amino_acids.py、sequence_tools.py），不要手算。
适用场景：基因/蛋白序列获取、直系同源比较、结构域与变异注释、FASTQ 质控与比对统计。
限制：序列、坐标与结构域边界必须查库，不得凭记忆重建；基因名有歧义时需确认具体亚基；收费、价格与平台信息暂未提供。