用途：面向蛋白质结构检索与质量评估的技能，聚合实验结构与预测模型，帮助确认某蛋白有哪些可用结构、质量如何、是否含配体或结合位点，用于结构生物学、药物设计与机制研究的前期调研。
主要能力：按PDB ID直接取回；按UniProt获取AlphaFold预测并检索实验结构；按蛋白名搜索。可获取条目元数据、实验信息、质量评分、配体列表、相似结构；按UniProt获取全部PDB条目与配体结合位点。SWISS-MODEL支持同源模型与重索引实验条目的区分、按残基区间与模板过滤、下载坐标文本、批量查询最多250个UniProt。3D-Beacons跨PDBe、SWISS-MODEL、AlphaFold DB、AlphaFill、ModelArchive统计结构与类别，并映射残基级域/结合注释。PDB-REDO提供X射线条目的再精修质量指标与版本信息。
使用方式：工具调用一律用英文，可用用户语言回复。流程为澄清（仅在名称歧义、物种未定或实验/预测需求不明时）→身份消歧→静默检索→输出结构画像报告，隐藏检索过程。建议先调用3D-Beacons结构概要做来源覆盖判断，再深入PDBe/RCSB、AlphaFold或SWISS-MODEL。
质量与限制：X射线分辨率优于2Å适合药物设计，冷冻电镜3–4Å适合折叠但侧链不可靠，AlphaFold对无序区不可靠，需查看pLDDT或分辨率。quality分层为优秀（X射线<1.5Å、完整、R-free<0.22）到低（>4.0Å或不完整）。QMEAN常缺失，宜用覆盖度、模板、方法评估。PDB ID须为4字符，缺失结构可改提供AlphaFold或相似蛋白建议。工具调用不得臆测PDB ID与分辨率，须实际查询确认。