用途：面向蛋白质相互作用（PPI）网络分析，通过 ToolUniverse 工具调用多个数据库完成标识符映射、互作网络检索、功能富集分析及可选的结构数据查询，并支持因果信号通路、复合物组成和成药性等扩展分析。
主要能力：STRING（14M+ 蛋白，无需 API Key）作为主互作来源，返回 score、escore（实验证据）、dscore、tscore、ascore 等边字段；BioGRID（2.3M+ 互作，需 API Key）作为精选数据回退；SASBDB 提供 SAXS/SANS 溶液结构；Complex Portal 提供经整理的复合物成员与化学计量；SIGNOR 提供带方向、机制、残基和 PMID 的因果信号边；另含 OmniPath、Reactome、DGIdb、gnomAD、CIViC、UniProt、IntAct、EBI Proteins 等工具。
使用方式：四阶段工作流——STRING_map_identifiers 校验并映射标识符；STRING_get_network（主）或 BioGRID_get_interactions（回退）；STRING_functional_enrichment 与 STRING_ppi_enrichment 做富集；SASBDB_search_entries 取结构数据。关键参数 proteins（必填）、species 默认 9606、confidence_score 默认 0.7、include_biogrid 默认 False、include_structure 默认 False。BioGRID 需设置 BIOGRID_API_KEY。示例见 python_implementation.py 的 example_tp53_analysis() 与 analyze_protein_network()。
适用场景：需要区分物理结合与功能互作、追踪定向因果路径、查询已知复合物成员、评估枢纽蛋白成药性或基因约束时使用。
限制：高 combined_score 不等于物理结合，判断结合应看 escore；BioGRID 化学互作覆盖可能不完整；Complex Portal 的 get_complex 可能回显 complex_id/name 为 null，应依据 systematic_name 与 subunits 确认；互作数据覆盖与实验证据类型以各数据库为准，未提供的收费与更多平台细节暂未说明。