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设计与创作

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更新于 10-16 01:16

技能介绍

用途:该技能用于把正在进行的 binder(结合体)设计工作整理为可复现的候选决策,并形成如实描述的实验或竞赛提交材料。它保留用户已选的模型、基础设施和目标;不授予上传未发表设计、发布仓库或接受条款的权限。

主要能力:先建立当前决策状态,对已有活动读取最新状态、清单、已执行结果与失败记录,区分已完成与进行中;记录靶点异构体/物种、检测构建体与末端、目标表位、糖基化假设、分子类别、可设计位置与目标方向,并明确区分酸性pH下更强结合与中性pH结合加酸性释放。竞赛场景需核实实时挑战、账号赛道、截止时间、新颖性定义与分子格式,把截止时间换算为显式UTC偏移(AoE为UTC−12)。之后选择下一次有信息量的计算,优先解决执行或输入缺陷,用已知阳性对照走同一制备与打分流程,把计算用在真正的不确定性上。

使用方式与证据:用 structure-validation.md 做身份映射、侧链、糖基与对照;用 ph-selectivity.md 处理条件性结合;在重启失败任务或扩大模型覆盖前读 compute-and-provenance.md。设计证据需分维度报告,pLDDT、pTM、低冲突数或松弛结构不能作为实验支持证据。保持可恢复证据:稳定序列身份与哈希、版本化参数、输入输出哈希、软件/检查点版本、结构映射与显式失败原因。提交前读 submission.md 并运行本地辅助脚本:python scripts/preflight_submission.py candidates.csv --methods methods.txt --source-csv source_candidates.csv --min-length 10 --max-length 250 --max-designs 20。该脚本不联网、不提交,也无法证明官方新颖性、权利、科学评审或完全无敏感信息。

适用场景与限制:适用于多模型家族、结构/糖基检查与条件pH假设的迭代设计活动及竞赛提交准备。限制包括:计算不能建立检测阈值;模型不一致时不应把无关单位平均成共识;未提供的收费、价格、平台细节等暂未提供。