用途：识别、注释并解读非编码RNA及其生物学作用，覆盖miRNA、lncRNA、circRNA、snoRNA等类别。核心原则是类别决定功能、靶标比ncRNA本身更重要、表达具有组织特异性、保守性提示功能，并按T1（验证靶标）到T4（仅序列预测）分级证据。
主要能力：miRBase查询miRNA名称、登录号、序列与家族；LNCipedia查询lncRNA转录本、结构、保守性与文献；RNAcentral跨库检索所有ncRNA类型，并可获取基因组坐标与FASTA序列；Rfam查询RNA家族；MODOMICS查询RNA化学修饰；ENCORI_get_miRNA_targets查询miRNA-靶基因互作（含CLIP-seq支持与预测程序）；DisGeNET、PubMed、GTEx用于疾病关联、文献与组织表达。
使用方式：先按名称或序列判定类别，再选证据源。miRNA靶标优先用ENCORI_get_miRNA_targets(mirna="hsa-miR-21-5p", clip_min=1)或按基因反查；lncRNA机制需检索PubMed；序列与坐标可用RNAcentral_get_genome_locations、RNAcentral_get_sequence。靶标通路富集可用ReactomeAnalysis_pathway_enrichment与STRING_get_network。TargetScan与miRTarBase无稳定API，需下载后本地处理。
适用场景：查询miR-21靶标、寻找与某疾病相关的lncRNA、判断lncRNA跨物种保守性、注释ncRNA ID、筛选疾病生物标志物miRNA。
限制：miRNA靶标预测假阳性率高，应优先采用实验验证结果；仅约5%注释lncRNA有已知功能；不同检测方法覆盖的ncRNA类别不同；lncRNA常具物种特异性，跨物种比较不可靠。MODOMICS_get_modification已损坏，指定ID会返回固定记录，不要使用；SMILES、单同位素质量等字段暂无法获取。mRNA表达分析、CRISPR筛选不属于本技能范围。