用途:面向天然产物化学与代谢组学分析,回答“这个化合物是否已被报道过、由什么微生物产生、属于哪类化学结构”。
主要能力:通过 NPAtlas 检索并去重复微生物天然产物(细菌与真菌),获取 NPAID、产生菌及分类谱系、文献出处;用 ClassyFire 按 InChIKey 分配 ChemOnt 分类(kingdom→superclass→class→subclass→direct_parent);用 PubChem 交叉核对身份;用 LOTUS 覆盖植物、动物、海洋无脊椎动物等更广来源;用 MIBiG 查找已表征的生物合成基因簇。
使用方式:先判断输入类型(名称、分子式、精确质量、InChIKey、SMILES)。系统命名经 OPSIN 转结构,俗名/商品名经 PubChem 取 InChIKey。以 InChIKey 做精确 NPAtlas 匹配,分子式或精确质量检索会返回同分异构候选。命中后调用 NPAtlas_get_compound 获取产生菌与文献。
适用场景:新 MS 特征的去重复、微生物天然产物来源与文献追溯、化学分类注释、基因簇关联。
限制:NPAtlas 仅覆盖微生物天然产物,无命中不等于全新;名称检索不等于结构匹配;分子式命中只是候选列表;ClassyFire 为缓存查询,classified:false 表示未缓存而非不可分类;OPSIN 仅解析系统 IUPAC 名;搜索结果中 origin_organism 为空,需取完整记录。所有身份、来源与分类结论须来自实时工具调用。