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更新于 10-16 01:16

技能介绍

用途:从癌症影像档案(TCIA)中发现并刻画公开癌症影像队列,获取集合、患者、研究、DICOM 序列级元数据,用于搭建或界定放射影像研究队列。

主要能力:枚举集合、患者、研究与序列;按模态、身体部位、制造商筛选;拉取序列级 DICOM 元数据(扫描仪、采集参数、许可);估算序列下载大小;列出单个 DICOM 实例(切片)UID;区分真实患者与模体/QA 测试对象。包含 10 个工具:TCIA_list_collections、TCIA_get_patients、TCIA_get_patient_studies、TCIA_get_series、TCIA_get_modality_values、TCIA_get_body_part_values、TCIA_get_manufacturer_values、TCIA_get_series_metadata、TCIA_get_series_size、TCIA_get_sop_instance_uids。

使用方式:先确认集合名(如 TCGA-GBM、TCGA-LUAD、LIDC-IDRI),不要猜测;可选用 facet 工具刻画集合;再按 Collection 枚举患者,检查 Phantom 字段排除 QA 模体;随后按患者查研究、序列,取得 SeriesInstanceUID;最后按需查看序列元数据或估算大小。集合、PatientID、模态、身体部位区分大小写,须使用工具返回的精确值。

适用场景:为特定癌种或器官寻找公开影像集合,统计患者/研究/序列数量,查看模态、部位、制造商分布,获取某序列设备与采集参数,估算下载体量。

限制:不能下载或查看实际像素数据,不能运行分割/检测模型或解读图像;显微/细胞成像量化、肿瘤基因组数据应使用其他技能。TCIA 数据已去标识,研究/序列日期常被替换为占位值(如 2000-01-01),不可视为真实采集日期。许可以序列而异,通常为 CC-BY 或 CC-BY-NC。