用途：分析 TCR/BCR 免疫组库测序数据（AIRR-seq），刻画适应性免疫应答、克隆扩增与抗原特异性。
主要能力：提供 8 阶段工作流——数据导入与克隆型定义（支持 MiXCR、ImmunoSEQ、AIRR 标准、10x VDJ；克隆型方法 cdr3aa、cdr3nt、vj_cdr3）；多样性与克隆性指标（Shannon 熵、Simpson、逆 Simpson、Gini、克隆性、丰富度、稀释曲线）；V(D)J 基因使用与 V-J 配对及卡方偏倚检验；CDR3 长度分布与氨基酸组成；克隆扩增检测（默认 95 百分位阈值）与纵向追踪；收敛重组与公共克隆型识别；表位预测与特异性查询；与单细胞数据整合（克隆型映射 barcode、UMAP 表型、差异表达）。
使用方式：通过 ToolUniverse 调用相关工具，如 iedb_search_tcell_assays、iedb_search_bcell、iedb_search_epitopes、BVBRC_search_epitopes、VDJDB_search_cdr3、VDJDB_get_antigen_specificity、VDJDB_get_database_summary、NCBI_SRA_search_runs、ImmPort_search_studies、PubMed_search_articles、UniProt_get_entry_by_accession。示例流程：load_airr_data("clonotypes.txt", format='mixcr')，define_clonotypes(tcr_data, method='vj_cdr3')，calculate_diversity(clonotypes['count'])，detect_expanded_clones(clonotypes)，analyze_vdj_usage(tcr_data)，query_epitope_database(top_clones)。
适用场景：感染、肿瘤浸润淋巴细胞、疫苗应答、自身免疫、免疫治疗与纵向随访研究，以及单细胞转录组联合分析。
限制：资料强调“查询而非猜测”，阈值、CDR3 长度范围、收敛比等应查 IEDB/VDJdb；不得仅凭 CDR3 推断抗原；需与健康供体参考分布比较；需用稀释曲线评估测序深度（建议 50,000–100,000 reads）；结果按强/中/弱/不足分级。具体收费、平台与价格暂未提供。