SuperAPI AI 工具集

tooluniverse-gwas-drug-discovery

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更新于 10-16 01:16

技能介绍

用途:把全基因组关联研究(GWAS)信号转化为可操作的药物靶点和药物重定位机会,覆盖从疾病关联到靶点评估、已有药物检索与安全性查询的流程。

主要能力:按疾病或SNP检索GWAS关联;用OpenTargets获取精细定位可信集与L2G预测;评估靶点可成药性、分类、安全性和基因组位置;检索疾病相关药物、药物作用机制与ChEMBL生物活性;查询FDA不良反应、活性成分与药物警告;通过PubMed、EuropePMC、ClinicalTrials检索文献与试验。

使用方式:基于ToolUniverse,先执行 tu = ToolUniverse(); tu.load_tools(),再调用工具。示例:tu.tools.gwas_get_associations_for_trait(disease_trait="type 2 diabetes");tu.tools.OpenTargets_get_target_tractability_by_ensemblID(ensemblId="ENSG00000148737");tu.tools.DGIdb_get_drug_gene_interactions(genes=["TCF7L2"])。工具调用使用英文术语,回复可用用户语言。

参数注意:GWAS关联用disease_trait而非trait,无p_value_threshold参数需客户端过滤;OpenTargets用ensemblId(小写d);研究检索用efo_trait;OpenTargets疾病药物查询可能返回HTTP 400,可回退到DGIdb按基因查询。

适用场景:靶点发现与优先级排序、药物重定位假设生成、遗传证据与临床证据整合。

限制:资料未提供具体收费、平台支持范围或效果保证;结果依赖数据库覆盖与质量,需结合功能验证,不应直接作为临床决策依据。