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更新于 10-16 01:16

技能介绍

用途:评估降低某个人类基因功能是否可能不安全。输入基因符号、名称、Ensembl ID 或 UniProt 登录号,并记录干预方式(敲除、敲低、降解剂、不可逆/可逆抑制剂、抗体或未知)、目标组织与适应症、期望抑制深度与持续时间。若未提供干预方式,则按全身完全功能缺失评估并显著标注该假设。

主要能力:先解析基因,再收集人类与模型系统证据,按五个维度打分:人类遗传约束(25)、哺乳动物敲除表型(25)、关键器官表达(20)、已观察到的在靶效应(20)、细胞必需性与冗余(10)。评分公式为 100×得分/可用权重,并报告证据覆盖率与置信度。分值区间:0–24 低、25–49 中、50–74 高、75–100 极高;覆盖率低于60%时只报告“证据不足”。

使用方式:用 MyGene_query_genes(species="human")解析基因并要求精确匹配;随后分别调用 gnomad_get_gene_constraints、OpenTargets_get_biological_mouse_models_by_ensemblID、GTEx_get_median_gene_expression、OpenTargets_get_target_safety_profile_by_ensemblID、DepMap_get_gene_dependencies 等工具,并可用 OpenTargets_get_associated_drugs_by_target_ensemblID 区分已观察毒性与假设风险。证据分级 T1–T4,缺失数据视为未知而非安全。

适用场景:靶点安全性初筛、基因干预策略选择、需要透明评分与证据引用的研究评估。

限制:不评估靶点有效性或成药性;DepMap 仅代表癌细胞必需性,不代表正常组织;不得将敲除结果外推到部分或组织限制性药理作用;矛盾证据需报告而非平均;输出以“This is a research risk assessment, not a clinical safety determination.”结尾。