用途
本技能面向生态学、生物多样性与保护生物学研究，提供物种鉴定、分类查询、入侵物种影响评估、授粉生态、种群动态、群落生态与食物网、进化生态等问题的分析支持。其核心原则是“先查询，不臆测”（LOOK UP DON'T GUESS），以及“计算，而非描述”（COMPUTE, DON'T DESCRIBE）。
主要能力
物种与分类查询
- GBIF 系列工具：物种检索（GBIF_search_species）、出现记录（GBIF_search_occurrences）、分类树向上追溯（GBIF_get_taxon_parents）、向下展开（GBIF_get_taxon_children）、同物异名（GBIF_get_taxon_synonyms）、俗名（GBIF_get_vernacular_names）、名称解析（GBIF_parse_name）。
- WoRMS_search_species：海洋物种分类。
- ensembl_get_taxonomy、NCBIDatasets_get_taxonomy：分类学分级查询。
- IUCN_get_conservation_status：按学名查询 Red List 濒危等级（CR/EN/VU/NT/LC），是权威的灭绝风险评估来源，需免费的 IUCN_API_KEY。
标本与生物多样性补充来源
- iDigBio_search_records / iDigBio_get_record：检索 1.3 亿以上数字化博物馆/标本馆标本记录（Darwin Core），补充物理标本来源信息。
- BOLDSystems_search_by_taxon / _search_by_bin / _get_record：基于 DNA 条形码（COI）的物种鉴定，BIN 聚类按条码相似度分组，适用于 GBIF 基于名称的检索无法解决的隐存种问题。
- EOL、ITIS、CoL、Open Tree of Life、iNaturalist、OBIS、eBird、Marine Regions 等八个补充来源，提供权威分类标准、系统发育树、公民科学观测密度与海洋地理边界等 GBIF 未覆盖的信息。
文献检索
- PubMed_search_articles、EuropePMC_search_articles：检索生态学相关研究文献。
使用方式
各工具通过 ToolUniverse 的 run_tool 调用，例如：
key = tu.run_tool("GBIF_match_name", {"name": "Panthera leo"})["data"]["usageKey"] # 5219404
tu.run_tool("GBIF_get_taxon_parents", {"taxon_key": key})
tu.run_tool("GBIF_get_taxon_synonyms", {"taxon_key": key})
tu.run_tool("GBIF_get_vernacular_names", {"taxon_key": key, "language": "eng"})
tu.run_tool("GBIF_get_taxon_children", {"taxon_key": 2435194, "limit": 8})
tu.run_tool("GBIF_parse_name", {"name": "Quercus robur L."})
上述五个 GBIF 工具均访问公开 GBIF API，无需 key；起始 taxon_key 可来自 GBIF_match_name 或 GBIF_search_species。
其他调用示例：
tu.run_tool("EOL_search_species", {"query": "Panthera leo"}) # page_id 1270491
tu.run_tool("ITIS_search_by_scientific_name", {"scientific_name": "Panthera leo"}) # tsn 183803
tu.run_tool("CoL_search_species", {"q": "Panthera leo"}) # 293 CoL-database matches
tu.run_tool("OpenTree_match_names", {"names": "Panthera leo,Panthera tigris"})
tu.run_tool("OpenTree_get_mrca", {"ott_ids": "417950,770315"})
tu.run_tool("OpenTree_get_induced_subtree", {"ott_ids": "417950,770315,312031"})
tu.run_tool("OBIS_search_taxa", {"scientificname": "Rhincodon typus"})
tu.run_tool("MarineRegions_search_by_name", {"name": "Mediterranean Sea"}) # MRGID 25180
tu.run_tool("iNaturalist_search_taxa", {"query": "Panthera leo"})
注意：OpenTree_match_names 的 names 参数是逗号分隔的字符串，而非 JSON 数组。
分析框架
技能提供多个推理框架：物种与分类问题、入侵物种影响评估（生态位重叠、繁殖率、天敌释放、生态系统工程效应）、授粉生态（觅食行为、相互作用类型、观测方法限制、统计考量、行为谱解读）、种群动态（指数/逻辑斯谛增长、Allee 效应、确定性 vs 随机灭绝、生存分析）、群落生态与食物网（营养级联、关键种、岛屿生物地理学、竞争排斥）、进化生态（警戒色、拟态、生活史权衡、生死模型）。
适用场景与限制
适用于需要跨多个权威来源核对物种身份、分布、濒危状态、系统发育关系或文献证据的生态学研究，以及需要统计分析的种群与群落问题（建议先用工具取数，再用 pandas、scipy、statsmodels、matplotlib 运行 Python 分析）。
注意事项：不同系统的标识符不可互换（同一物种在 GBIF 的 usageKey、ITIS 的 tsn、CoL 的 taxon_id、EOL 的 page_id、Open Tree 的 ott_id、iNaturalist 的 taxon_id、OBIS 的 AphiaID 各不相同），应在同一系统内解析后使用。IUCN 工具需要免费的 API key，其余多数工具无需 key。涉及微生物灭绝点等分析时需使用生存分析，而非简单 t 检验。资料中未提供本技能的收费、价格或平台安装方式等信息。