用途:回答“某药的作用机制是什么”“主要分子靶点有哪些”“影响哪些通路”“有哪些药物基因组学相互作用”“脱靶效应”“两药机制比较”等问题。不适用于药物安全性/不良事件、药物重定位、靶点成药性、网络药理学及 CPIC 剂量指南等,另有对应技能。
主要能力:按固定链路“靶点→下游效应→通路→器官效应→临床结局”开展调查,强调“如何调查”而非罗列已知药理学知识。可解析药物标识(OpenTargets、PharmGKB、ChEMBL),获取作用机制与靶基因、action_type、direct_interaction 及文献引用,评估脱靶(ChEMBL 生物活性、STRING 互作),映射通路(KEGG、Reactome、WikiPathways、STRING 注释及富集),读取标签(DailyMed 临床药理学、药物相互作用、禁忌等),查药物基因组学(CPIC、FDA 生物标志物、PharmGKB),检索文献(PubMed、EuropePMC),最后按证据分层(Tier 1 监管、Tier 2 实验、Tier 3 数据库、Tier 4 文献)整合报告。
使用方式:分 8 步进行,进入前先解析用药名到 ChEMBL ID。示例调用:tu.tools.OpenTargets_get_drug_id_description_by_name(drugName="metformin")、tu.tools.ChEMBL_get_drug_mechanisms(drug_chembl_id="CHEMBL1431")、tu.tools.KEGG_get_gene_pathways(gene_id="hsa:5562")、tu.tools.DailyMed_search_spls(drug_name="metformin")。比较两药时对两药分别执行第 2–4 步再对齐。已知问题:OpenTargets_get_associated_targets_by_drug_chemblId 可能因 GraphQL 变更失败,改从 MOA 结果提取靶点;MetaCyc 需付费账号不可用,改用 KEGG/Reactome/WikiPathways。
适用场景:药理机制梳理、脱靶与相互作用分析、通路定位、PGx 证据汇总及多药机制对照。
限制:本资料未提供具体收费方式、部署步骤或效果保证,相关细节暂未提供;部分工具存在已知失败或依赖付费账号的问题。