用途：系统化开展 TCGA/GDC 癌症基因组学分析，覆盖队列定义、临床数据、体细胞突变、拷贝数变异、生存分析与变异临床解读。核心原则是先明确癌症类型与数据类型，用 GDC 过滤器构建队列后再分析；未指定 project_id 的泛癌突变计数缺乏意义。
主要能力：GDC_list_projects 列出项目与病例数；GDC_search_cases 检索病例 UUID；GDC_get_clinical_data 获取人口学、诊断与治疗信息（单次最多 100 例，需用 offset 分页，age_at_diagnosis 以天计）；GDC_get_mutation_frequency 返回泛癌 SSM 总数，GDC_get_ssm_by_gene 按项目返回具体突变与氨基酸改变；Progenetix_search_biosamples 与 Progenetix_cnv_search 查询 CNV（GRCh38 坐标，variant_type 用 DUP/DEL，filters 需 NCIt CURIE 如 NCIT:C4017）；GDC_get_survival 返回 Kaplan-Meier 供体数组与随访摘要（仅前 50 名供体，无 log-rank p 值，需自行比较或计算）；OncoKB_annotate_variant 给出致癌性与治疗等级，无 ONCOKB_API_TOKEN 时仅演示模式（BRAF、TP53、ROS1）。
使用方式：按六阶段流程调用工具，先确认项目 ID 与 NCIt 编码，不要臆测。示例：tu.tools.GDC_get_ssm_by_gene(gene_symbol="TP53", project_id="TCGA-LUAD", size=50)；tu.tools.GDC_get_survival(project_id="TCGA-BRCA", gene_symbol="TP53")；tu.tools.OncoKB_annotate_variant(gene="KRAS", variant="G12C", tumor_type="LUAD")。结果被截断或需批量数据时可直接调用 GDC API。
适用场景：特定癌种基因突变频率、生存数据、CNV 扩增/缺失、变异临床意义注释。
限制：生存分析为回顾性、未按治疗分层，小样本不可靠；不支持多基因或分期分层；Progenetix 仅用 GRCh38；OncoKB 完整访问需令牌。精准肿瘤治疗建议、罕见病基因发现、GWAS 解读应使用其他技能。