用途:在 ToolUniverse 中把 TranscriptFormer 配置为远程工具,完成环境搭建、启动、校验与故障排查,并可通过 ToolUniverse Connect 中继共享给他人。若只是把模型分享给用户而非开发模型,应改用 tooluniverse-share-computer 指南,无需检出 ToolUniverse 源码。
主要能力:模型运行在独立 Python 环境中,依赖通过 uv 创建虚拟环境并安装 ToolUniverse 与 TranscriptFormer 的 requirements;可用 tu remote check 检查缺失项,用 tu serve 启动并共享。提供 run_transcriptformer_embedding_retrieval 操作,输入 state、cell_type、gene_names、disease 等参数,返回有界上下文嵌入记录与查询元数据。
使用方式:先创建隔离环境(python3 -m venv .venvs/transcriptformer 并安装依赖),设置 TRANSCRIPTFORMER_DATA_PATH 等提供方资源,运行 python scripts/remote_validation/setup_skill_preflight.py --implementation transcriptformer 做契约检查,再启动本地服务 python -m tooluniverse.remote.transcriptformer.transcriptformer_tool,端点 http://127.0.0.1:7000/mcp。共享前用 tu remote login 登录一次,再用 tu remote share transcriptformer 共享;中继 SDK 需安装指定 wheel。
适用场景:需要以远程 MCP 工具形式提供 TranscriptFormer 嵌入检索,或通过 Connect 中继共享给授权调用者。
限制:校验状态显示生产级 TranscriptFormer 产物、公开发布、跨用户隔离、规模与科学价值验证仍不完整;公开出版与独立调用者授权/隔离未测试。仅 CPU 检索,需按嵌入规模配置内存。应绑定回环地址,非回环绑定需 TOOLUNIVERSE_API_TOKEN。凭据、权重、缓存不得进入 Git。默认单 worker 为保守未测量值,需自行测量冷启动与并发。部分提供方操作可能因凭据返回 403。仅使用实现 README 链接的官方上游文档。