用途
RFD4-Proteina 是一个远程工具提供方（provider）的部署技能，用于在 Linux + CUDA GPU 主机上安装、启动、验证与排查 RFD4-Proteina 蛋白质设计工具，并可选地通过 ToolUniverse Connect 中继对外分享。已在 NVIDIA GB10（aarch64、cc 12.1、128 GB 统一内存）、驱动 580.173.02 上通过该提供方自身路径验证。
主要能力
- 按远程工具标准建立两个隔离环境：MCP 服务器运行于 ToolUniverse 环境，模型运行于由固定 lock 文件构建的独立环境，两者不可互相导入。
- 提供
tu remote setup分步执行：preflight、environment、weights、smoke；smoke 步骤加载模型、发送请求、断言产出*_generated.cif，并把实测峰值 VRAM 记录到~/.cache/tooluniverse/measured/rfd4_proteina.json。 - 提供契约检查脚本
scripts/remote_validation/setup_skill_preflight.py，支持--check-provider-env、--live、--check-connect-prereqs等选项。 - 支持本地 MCP 端点 http://127.0.0.1:8062/mcp，工具名为
rfd4_proteina_design。 - 支持通过 ToolUniverse Connect 中继分享（
tu remote share），默认使用浏览器设备授权，无需复制粘贴密钥。
使用方式
- 前置条件：ToolUniverse 仓库根目录、Linux、Python 3.12.3、CUDA GPU；provider 数据、权重、缓存与凭据不得放入 Git；绑定 loopback，非 loopback 绑定需
TOOLUNIVERSE_API_TOKEN。 - 先运行标准库契约检查，再创建
.venvs/rfd4_proteina虚拟环境并安装-e .与 fastmcp。 - 在
TOOLUNIVERSE_RFD4_PROTEINA_PYTHON指定路径创建空解释器，由tu remote setup --only environment从requirements.lock以--no-deps填充。 - 设置
TOOLUNIVERSE_RFD4_PROTEINA_PYTHON，可选设置RFD4_PROTEINA_HF_HOME（默认~/.cache/tooluniverse/rfd4_proteina-hf），然后执行tu remote setup rfd4_proteina。 - 本地启动：
python -m tooluniverse.remote.rfd4_proteina.rfd4_proteina_tool，用 fastmcp Client 列出工具确认包含rfd4_proteina_design。 - 分享：
tu remote login后每次执行tu remote share rfd4_proteina；可用--name、--workers覆盖默认值；tu remote check、tu remote run分别用于就绪检查与仅本地前台运行。 - Connect 中继需安装固定 SHA-256 的
tuplatform-connectwheel，并用tu doctor、tu serve验证。
典型请求
操作 rfd4_proteina_design，参数包括 input_cif（带注释的 mmCIF，注释即设计规范）、num_replicates、seed。成功时返回 n_designs、含 design_id、链序列与 n_atoms 的 designs 数组、耗时、peak_reserved_gib、weights_held_by；return_structures 为 true 时才返回设计 mmCIF 文本。证据测量所用的输入位于 src/tooluniverse/remote/rfd4_proteina/smoke/monomer.cif。
适用场景与限制
适用于在单张 CUDA 卡上私有部署并验证 RFD4-Proteina 推理服务。限制：需 CUDA GPU，不面向 CPU；建议单 worker，第二个在途请求会在锁上排队；manifest 的 VRAM 数据基于 100 残基测得，上游设计上限 1024 tokens，更长输入未实测；refolding 指标不计算；仅验证了无条件单体模式，六种条件化设计形态未运行；设计质量未验证，无条件输入产生带电重复螺旋；公开出版、跨用户隔离、并发、恢复与长输入均未测试，应保持私有部署；该实现未经过 Platform 矩阵验证。