用途
该技能用于部署 ToolUniverse 的 BioEmu-2 远程工具：完成环境准备、权重下载与固定、冒烟验证、本地启动，并可选择通过 ToolUniverse Connect 中继对外共享。适用于在具备 NVIDIA CUDA GPU 的 Linux 主机（Python 3.12.3，从 ToolUniverse 仓库根目录运行）上搭建 BioEmu-2 结构采样服务。
主要能力
- 预检：运行
python scripts/remote_validation/setup_skill_preflight.py --implementation bioemu2，可追加--check-provider-env、--live（不跑模型，仅校验 MCP 工具集）和--check-connect-prereqs（仅报告密钥是否设置，不打印值）。 - 双环境安装：MCP 服务器运行在 ToolUniverse 环境，模型运行在独立环境
TOOLUNIVERSE_BIOEMU2_PYTHON指向的解释器中，由tu remote setup --only environment依据requirements.lock以--no-deps填充。资料记录了 bioemu2 仅以 0.1.0rc0 发布、hydra-core 1.3.7 与 omegaconf 2.3.0 配对的解析陷阱。 - 四步设置：
tu remote setup bioemu2，可用--only preflight|environment|weights|smoke分步执行。冒烟步骤加载模型、发送一次请求、断言产出topology.cif和samples.xtc，并把实测峰值显存写入~/.cache/tooluniverse/measured/bioemu2.json。 - 凭据与权重：无需凭据，检查点在 Hugging Face Hub 上以 MIT 许可公开；
BIOEMU2_HF_HOME指定缓存目录（默认~/.cache/tooluniverse/bioemu2-hf）。启动时若文件偏离固定值则拒绝运行。 - 共享与本地运行：
tu remote login后tu remote share bioemu2进行私有共享；tu remote check为非共享就绪检查，tu remote run为本地前台服务器。 - 本地验证：
python -m tooluniverse.remote.bioemu2.bioemu2_tool启动后，Streamable HTTP 端点为http://127.0.0.1:8063/mcp，需确认工具发现包含bioemu2_sample_structures。 - 调用示例：
bioemu2_sample_structures接受sequences、mode、num_samples、seed、msa_a3m等参数；对配体、核酸、修饰残基等可使用system_yaml。返回包含 mode、num_samples、tokens、chains、msa 来源、physicality、files、timing、weights_held_by 与显存指标；return_topology默认关闭。
适用场景与限制
资料验证状态（2026-10-25）显示：仅在 NVIDIA GB10 单卡上通过本 provider 路径完成四步设置，冒烟测试 89 秒通过，MCP 端点 3 次正确调用、6 次畸形请求返回命名拒绝。仅蛋白质链经过 worker；配体、RNA、DNA、接触条件化、引导采样及除 high_quality 外的物理性模式均未测试。集成准确度未验证，物理性报告只描述几何，采样频率不是校准的玻尔兹曼概率。公开出版、跨用户隔离、并发、恢复与长输入未测试，建议保持私有部署。GPU 侧建议单 worker，按 vram_budget_gb（声明 16.0 GiB）而非分配峰值做预算；token 上限 448，token 数不等于残基数。